Protein–RNA interactions for Protein: P61028

Rab8b, Ras-related protein Rab-8B, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8bP61028 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab8bP61028 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab8bP61028 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab8bP61028 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab8bP61028 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab8bP61028 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab8bP61028 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab8bP61028 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab8bP61028 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab8bP61028 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab8bP61028 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab8bP61028 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab8bP61028 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab8bP61028 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab8bP61028 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab8bP61028 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab8bP61028 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab8bP61028 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab8bP61028 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab8bP61028 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab8bP61028 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rab8bP61028 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab8bP61028 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab8bP61028 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab8bP61028 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab8bP61028 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab8bP61028 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab8bP61028 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab8bP61028 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab8bP61028 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab8bP61028 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab8bP61028 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab8bP61028 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab8bP61028 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab8bP61028 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab8bP61028 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab8bP61028 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab8bP61028 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab8bP61028 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab8bP61028 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab8bP61028 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab8bP61028 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab8bP61028 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab8bP61028 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab8bP61028 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rab8bP61028 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rab8bP61028 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rab8bP61028 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab8bP61028 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab8bP61028 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab8bP61028 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab8bP61028 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab8bP61028 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab8bP61028 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab8bP61028 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab8bP61028 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab8bP61028 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab8bP61028 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab8bP61028 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab8bP61028 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab8bP61028 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab8bP61028 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab8bP61028 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab8bP61028 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab8bP61028 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab8bP61028 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab8bP61028 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab8bP61028 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rab8bP61028 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rab8bP61028 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rab8bP61028 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rab8bP61028 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rab8bP61028 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rab8bP61028 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab8bP61028 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab8bP61028 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab8bP61028 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab8bP61028 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab8bP61028 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab8bP61028 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab8bP61028 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab8bP61028 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab8bP61028 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab8bP61028 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab8bP61028 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab8bP61028 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab8bP61028 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab8bP61028 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab8bP61028 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab8bP61028 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab8bP61028 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab8bP61028 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab8bP61028 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab8bP61028 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab8bP61028 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab8bP61028 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab8bP61028 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab8bP61028 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab8bP61028 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab8bP61028 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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