Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr2iP60898 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr2iP60898 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr2iP60898 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr2iP60898 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Polr2iP60898 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Polr2iP60898 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Polr2iP60898 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Polr2iP60898 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr2iP60898 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr2iP60898 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr2iP60898 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr2iP60898 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr2iP60898 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr2iP60898 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr2iP60898 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr2iP60898 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr2iP60898 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr2iP60898 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr2iP60898 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr2iP60898 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr2iP60898 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr2iP60898 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr2iP60898 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr2iP60898 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr2iP60898 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr2iP60898 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr2iP60898 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr2iP60898 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr2iP60898 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Polr2iP60898 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Polr2iP60898 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr2iP60898 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr2iP60898 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr2iP60898 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr2iP60898 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr2iP60898 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr2iP60898 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr2iP60898 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr2iP60898 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr2iP60898 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr2iP60898 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr2iP60898 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr2iP60898 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr2iP60898 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr2iP60898 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr2iP60898 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr2iP60898 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr2iP60898 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr2iP60898 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr2iP60898 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr2iP60898 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr2iP60898 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr2iP60898 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr2iP60898 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr2iP60898 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr2iP60898 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr2iP60898 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr2iP60898 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr2iP60898 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Polr2iP60898 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr2iP60898 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr2iP60898 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr2iP60898 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2iP60898 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2iP60898 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2iP60898 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2iP60898 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2iP60898 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2iP60898 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2iP60898 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2iP60898 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2iP60898 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2iP60898 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2iP60898 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2iP60898 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2iP60898 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2iP60898 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2iP60898 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Polr2iP60898 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr2iP60898 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr2iP60898 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr2iP60898 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr2iP60898 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr2iP60898 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr2iP60898 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr2iP60898 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2iP60898 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2iP60898 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2iP60898 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2iP60898 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2iP60898 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2iP60898 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2iP60898 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2iP60898 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2iP60898 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2iP60898 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2iP60898 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2iP60898 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr2iP60898 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms