Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Snap25P60879 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Snap25P60879 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Snap25P60879 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Snap25P60879 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Snap25P60879 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Snap25P60879 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Snap25P60879 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Snap25P60879 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Snap25P60879 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Snap25P60879 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Snap25P60879 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Snap25P60879 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Snap25P60879 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Snap25P60879 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Snap25P60879 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Snap25P60879 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Snap25P60879 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Snap25P60879 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Snap25P60879 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Snap25P60879 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Snap25P60879 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Snap25P60879 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Snap25P60879 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Snap25P60879 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Snap25P60879 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Snap25P60879 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Snap25P60879 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Snap25P60879 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Snap25P60879 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Snap25P60879 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Snap25P60879 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Snap25P60879 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Snap25P60879 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Snap25P60879 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Snap25P60879 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Snap25P60879 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Snap25P60879 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Snap25P60879 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Snap25P60879 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Snap25P60879 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Snap25P60879 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Snap25P60879 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Snap25P60879 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Snap25P60879 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Snap25P60879 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Snap25P60879 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Snap25P60879 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Snap25P60879 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Snap25P60879 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Snap25P60879 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Snap25P60879 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snap25P60879 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snap25P60879 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snap25P60879 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snap25P60879 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Snap25P60879 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Snap25P60879 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Snap25P60879 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Snap25P60879 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Snap25P60879 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Snap25P60879 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Snap25P60879 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Snap25P60879 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Snap25P60879 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Snap25P60879 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Snap25P60879 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Snap25P60879 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Snap25P60879 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Snap25P60879 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Snap25P60879 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Snap25P60879 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Snap25P60879 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Snap25P60879 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Snap25P60879 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Snap25P60879 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Snap25P60879 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Snap25P60879 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Snap25P60879 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Snap25P60879 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Snap25P60879 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Snap25P60879 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Snap25P60879 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Snap25P60879 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Snap25P60879 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Snap25P60879 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Snap25P60879 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Snap25P60879 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Snap25P60879 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Snap25P60879 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Snap25P60879 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snap25P60879 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snap25P60879 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Snap25P60879 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snap25P60879 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snap25P60879 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Snap25P60879 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Snap25P60879 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Snap25P60879 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snap25P60879 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 464.1 ms