Protein–RNA interactions for Protein: P59110

Senp1, Sentrin-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp1P59110 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Senp1P59110 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Senp1P59110 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Senp1P59110 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Senp1P59110 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Senp1P59110 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Senp1P59110 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Senp1P59110 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Senp1P59110 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Senp1P59110 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Senp1P59110 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Senp1P59110 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Senp1P59110 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Senp1P59110 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Senp1P59110 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Senp1P59110 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Senp1P59110 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Senp1P59110 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Senp1P59110 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Senp1P59110 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Senp1P59110 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Senp1P59110 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Senp1P59110 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Senp1P59110 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Senp1P59110 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Senp1P59110 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Senp1P59110 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Senp1P59110 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Senp1P59110 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Senp1P59110 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Senp1P59110 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Senp1P59110 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Senp1P59110 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Senp1P59110 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Senp1P59110 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Senp1P59110 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Senp1P59110 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Senp1P59110 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Senp1P59110 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Senp1P59110 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Senp1P59110 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Senp1P59110 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Senp1P59110 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Senp1P59110 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Senp1P59110 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Senp1P59110 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Senp1P59110 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Senp1P59110 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Senp1P59110 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Senp1P59110 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Senp1P59110 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Senp1P59110 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Senp1P59110 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Senp1P59110 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Senp1P59110 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Senp1P59110 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Senp1P59110 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Senp1P59110 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Senp1P59110 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Senp1P59110 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Senp1P59110 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Senp1P59110 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Senp1P59110 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Senp1P59110 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Senp1P59110 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Senp1P59110 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Senp1P59110 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Senp1P59110 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Senp1P59110 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Senp1P59110 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Senp1P59110 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Senp1P59110 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Senp1P59110 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Senp1P59110 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Senp1P59110 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Senp1P59110 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Senp1P59110 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Senp1P59110 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Senp1P59110 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Senp1P59110 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Senp1P59110 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Senp1P59110 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Senp1P59110 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Senp1P59110 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Senp1P59110 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Senp1P59110 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Senp1P59110 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Senp1P59110 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Senp1P59110 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Senp1P59110 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Senp1P59110 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Senp1P59110 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Senp1P59110 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Senp1P59110 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Senp1P59110 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Senp1P59110 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Senp1P59110 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Senp1P59110 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Senp1P59110 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Senp1P59110 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms