Protein–RNA interactions for Protein: P58771

Tpm1, Tropomyosin alpha-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm1P58771 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tpm1P58771 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tpm1P58771 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tpm1P58771 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tpm1P58771 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tpm1P58771 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tpm1P58771 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tpm1P58771 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tpm1P58771 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tpm1P58771 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tpm1P58771 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tpm1P58771 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tpm1P58771 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tpm1P58771 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tpm1P58771 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tpm1P58771 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tpm1P58771 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tpm1P58771 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tpm1P58771 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tpm1P58771 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tpm1P58771 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tpm1P58771 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tpm1P58771 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tpm1P58771 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tpm1P58771 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tpm1P58771 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tpm1P58771 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Tpm1P58771 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tpm1P58771 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tpm1P58771 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tpm1P58771 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tpm1P58771 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tpm1P58771 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tpm1P58771 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tpm1P58771 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tpm1P58771 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tpm1P58771 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tpm1P58771 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tpm1P58771 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tpm1P58771 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tpm1P58771 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tpm1P58771 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tpm1P58771 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tpm1P58771 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tpm1P58771 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tpm1P58771 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tpm1P58771 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Tpm1P58771 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tpm1P58771 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tpm1P58771 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tpm1P58771 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tpm1P58771 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tpm1P58771 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tpm1P58771 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tpm1P58771 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tpm1P58771 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tpm1P58771 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tpm1P58771 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tpm1P58771 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tpm1P58771 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tpm1P58771 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tpm1P58771 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tpm1P58771 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tpm1P58771 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tpm1P58771 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tpm1P58771 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tpm1P58771 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tpm1P58771 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tpm1P58771 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tpm1P58771 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Tpm1P58771 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tpm1P58771 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tpm1P58771 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tpm1P58771 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tpm1P58771 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tpm1P58771 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tpm1P58771 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tpm1P58771 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tpm1P58771 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tpm1P58771 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tpm1P58771 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tpm1P58771 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tpm1P58771 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tpm1P58771 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tpm1P58771 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tpm1P58771 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tpm1P58771 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tpm1P58771 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tpm1P58771 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tpm1P58771 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tpm1P58771 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tpm1P58771 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tpm1P58771 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tpm1P58771 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tpm1P58771 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tpm1P58771 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tpm1P58771 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tpm1P58771 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tpm1P58771 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tpm1P58771 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.3 ms