Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Setd4P58467 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Setd4P58467 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Setd4P58467 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Setd4P58467 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Setd4P58467 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Setd4P58467 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Setd4P58467 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Setd4P58467 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Setd4P58467 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Setd4P58467 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Setd4P58467 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Setd4P58467 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Setd4P58467 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Setd4P58467 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Setd4P58467 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Setd4P58467 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Setd4P58467 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Setd4P58467 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Setd4P58467 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Setd4P58467 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Setd4P58467 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Setd4P58467 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Setd4P58467 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Setd4P58467 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Setd4P58467 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Setd4P58467 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Setd4P58467 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Setd4P58467 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Setd4P58467 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Setd4P58467 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Setd4P58467 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Setd4P58467 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Setd4P58467 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Setd4P58467 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Setd4P58467 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Setd4P58467 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Setd4P58467 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Setd4P58467 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Setd4P58467 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Setd4P58467 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Setd4P58467 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Setd4P58467 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Setd4P58467 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Setd4P58467 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Setd4P58467 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Setd4P58467 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Setd4P58467 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Setd4P58467 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Setd4P58467 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Setd4P58467 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Setd4P58467 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Setd4P58467 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Setd4P58467 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Setd4P58467 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Setd4P58467 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Setd4P58467 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Setd4P58467 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Setd4P58467 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Setd4P58467 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Setd4P58467 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Setd4P58467 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Setd4P58467 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Setd4P58467 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Setd4P58467 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Setd4P58467 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Setd4P58467 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Setd4P58467 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Setd4P58467 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Setd4P58467 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Setd4P58467 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Setd4P58467 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Setd4P58467 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Setd4P58467 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Setd4P58467 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Setd4P58467 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Setd4P58467 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Setd4P58467 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Setd4P58467 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Setd4P58467 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Setd4P58467 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Setd4P58467 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Setd4P58467 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Setd4P58467 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Setd4P58467 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Setd4P58467 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Setd4P58467 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Setd4P58467 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Setd4P58467 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Setd4P58467 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Setd4P58467 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Setd4P58467 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Setd4P58467 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Setd4P58467 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Setd4P58467 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Setd4P58467 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Setd4P58467 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Setd4P58467 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Setd4P58467 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Setd4P58467 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms