Protein–RNA interactions for Protein: P56960

Exosc10, Exosome component 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc10P56960 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Exosc10P56960 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Exosc10P56960 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Exosc10P56960 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Exosc10P56960 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Exosc10P56960 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Exosc10P56960 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Exosc10P56960 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Exosc10P56960 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Exosc10P56960 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Exosc10P56960 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Exosc10P56960 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Exosc10P56960 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Exosc10P56960 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Exosc10P56960 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Exosc10P56960 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Exosc10P56960 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Exosc10P56960 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Exosc10P56960 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Exosc10P56960 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Exosc10P56960 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Exosc10P56960 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Exosc10P56960 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Exosc10P56960 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Exosc10P56960 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Exosc10P56960 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Exosc10P56960 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Exosc10P56960 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Exosc10P56960 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Exosc10P56960 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Exosc10P56960 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Exosc10P56960 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Exosc10P56960 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Exosc10P56960 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Exosc10P56960 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Exosc10P56960 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Exosc10P56960 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Exosc10P56960 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Exosc10P56960 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Exosc10P56960 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Exosc10P56960 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Exosc10P56960 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Exosc10P56960 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Exosc10P56960 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Exosc10P56960 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Exosc10P56960 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Exosc10P56960 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Exosc10P56960 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Exosc10P56960 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Exosc10P56960 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Exosc10P56960 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Exosc10P56960 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Exosc10P56960 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Exosc10P56960 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Exosc10P56960 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Exosc10P56960 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Exosc10P56960 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Exosc10P56960 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Exosc10P56960 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Exosc10P56960 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Exosc10P56960 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Exosc10P56960 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Exosc10P56960 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Exosc10P56960 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Exosc10P56960 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Exosc10P56960 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Exosc10P56960 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Exosc10P56960 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Exosc10P56960 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Exosc10P56960 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Exosc10P56960 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Exosc10P56960 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Exosc10P56960 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Exosc10P56960 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Exosc10P56960 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Exosc10P56960 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Exosc10P56960 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Exosc10P56960 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Exosc10P56960 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Exosc10P56960 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Exosc10P56960 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Exosc10P56960 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Exosc10P56960 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Exosc10P56960 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Exosc10P56960 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Exosc10P56960 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Exosc10P56960 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Exosc10P56960 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Exosc10P56960 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Exosc10P56960 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Exosc10P56960 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Exosc10P56960 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Exosc10P56960 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Exosc10P56960 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Exosc10P56960 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Exosc10P56960 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Exosc10P56960 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Exosc10P56960 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Exosc10P56960 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Exosc10P56960 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms