Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd38P56528 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cd38P56528 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cd38P56528 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd38P56528 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd38P56528 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd38P56528 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd38P56528 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd38P56528 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd38P56528 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd38P56528 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cd38P56528 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cd38P56528 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd38P56528 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cd38P56528 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd38P56528 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd38P56528 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cd38P56528 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cd38P56528 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd38P56528 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd38P56528 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd38P56528 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cd38P56528 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cd38P56528 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd38P56528 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd38P56528 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd38P56528 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cd38P56528 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cd38P56528 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd38P56528 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd38P56528 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd38P56528 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cd38P56528 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd38P56528 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd38P56528 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd38P56528 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd38P56528 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd38P56528 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd38P56528 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd38P56528 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd38P56528 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd38P56528 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd38P56528 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd38P56528 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd38P56528 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd38P56528 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd38P56528 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd38P56528 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd38P56528 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd38P56528 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd38P56528 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd38P56528 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd38P56528 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd38P56528 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd38P56528 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd38P56528 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd38P56528 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd38P56528 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd38P56528 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd38P56528 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd38P56528 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd38P56528 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd38P56528 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd38P56528 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd38P56528 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd38P56528 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd38P56528 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd38P56528 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd38P56528 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd38P56528 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd38P56528 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd38P56528 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd38P56528 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd38P56528 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd38P56528 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd38P56528 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd38P56528 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd38P56528 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd38P56528 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd38P56528 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd38P56528 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd38P56528 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd38P56528 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd38P56528 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd38P56528 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd38P56528 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd38P56528 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd38P56528 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd38P56528 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd38P56528 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd38P56528 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd38P56528 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd38P56528 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd38P56528 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd38P56528 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd38P56528 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd38P56528 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd38P56528 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd38P56528 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd38P56528 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms