Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab4aP56371 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab4aP56371 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab4aP56371 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab4aP56371 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab4aP56371 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab4aP56371 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab4aP56371 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab4aP56371 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab4aP56371 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab4aP56371 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab4aP56371 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab4aP56371 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab4aP56371 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab4aP56371 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab4aP56371 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab4aP56371 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab4aP56371 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab4aP56371 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab4aP56371 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab4aP56371 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab4aP56371 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab4aP56371 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab4aP56371 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab4aP56371 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab4aP56371 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab4aP56371 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab4aP56371 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab4aP56371 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab4aP56371 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab4aP56371 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab4aP56371 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab4aP56371 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab4aP56371 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab4aP56371 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab4aP56371 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab4aP56371 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab4aP56371 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab4aP56371 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab4aP56371 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab4aP56371 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab4aP56371 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab4aP56371 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab4aP56371 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab4aP56371 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rab4aP56371 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rab4aP56371 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab4aP56371 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab4aP56371 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab4aP56371 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab4aP56371 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab4aP56371 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab4aP56371 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab4aP56371 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab4aP56371 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab4aP56371 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab4aP56371 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab4aP56371 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab4aP56371 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab4aP56371 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab4aP56371 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab4aP56371 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab4aP56371 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab4aP56371 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab4aP56371 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab4aP56371 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab4aP56371 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab4aP56371 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab4aP56371 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab4aP56371 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab4aP56371 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rab4aP56371 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rab4aP56371 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab4aP56371 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab4aP56371 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab4aP56371 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab4aP56371 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab4aP56371 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab4aP56371 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab4aP56371 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab4aP56371 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab4aP56371 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab4aP56371 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab4aP56371 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab4aP56371 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab4aP56371 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab4aP56371 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab4aP56371 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab4aP56371 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab4aP56371 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab4aP56371 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab4aP56371 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab4aP56371 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab4aP56371 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab4aP56371 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab4aP56371 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab4aP56371 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab4aP56371 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab4aP56371 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab4aP56371 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms