Protein–RNA interactions for Protein: P54761

Ephb4, Ephrin type-B receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb4P54761 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ephb4P54761 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ephb4P54761 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ephb4P54761 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ephb4P54761 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ephb4P54761 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ephb4P54761 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ephb4P54761 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ephb4P54761 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ephb4P54761 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ephb4P54761 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ephb4P54761 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ephb4P54761 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ephb4P54761 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ephb4P54761 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ephb4P54761 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ephb4P54761 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ephb4P54761 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ephb4P54761 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ephb4P54761 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ephb4P54761 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ephb4P54761 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ephb4P54761 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ephb4P54761 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ephb4P54761 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ephb4P54761 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ephb4P54761 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ephb4P54761 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ephb4P54761 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ephb4P54761 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ephb4P54761 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ephb4P54761 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ephb4P54761 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ephb4P54761 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ephb4P54761 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ephb4P54761 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ephb4P54761 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ephb4P54761 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ephb4P54761 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ephb4P54761 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ephb4P54761 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ephb4P54761 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ephb4P54761 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ephb4P54761 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ephb4P54761 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ephb4P54761 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ephb4P54761 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ephb4P54761 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ephb4P54761 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ephb4P54761 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ephb4P54761 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ephb4P54761 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ephb4P54761 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ephb4P54761 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ephb4P54761 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ephb4P54761 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ephb4P54761 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ephb4P54761 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ephb4P54761 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ephb4P54761 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ephb4P54761 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ephb4P54761 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ephb4P54761 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ephb4P54761 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ephb4P54761 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ephb4P54761 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ephb4P54761 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ephb4P54761 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ephb4P54761 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ephb4P54761 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ephb4P54761 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ephb4P54761 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ephb4P54761 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ephb4P54761 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ephb4P54761 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ephb4P54761 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ephb4P54761 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ephb4P54761 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ephb4P54761 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ephb4P54761 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ephb4P54761 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ephb4P54761 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ephb4P54761 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ephb4P54761 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ephb4P54761 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ephb4P54761 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ephb4P54761 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ephb4P54761 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ephb4P54761 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ephb4P54761 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ephb4P54761 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ephb4P54761 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ephb4P54761 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ephb4P54761 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ephb4P54761 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ephb4P54761 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ephb4P54761 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ephb4P54761 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ephb4P54761 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ephb4P54761 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms