Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ephb3P54754 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ephb3P54754 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ephb3P54754 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ephb3P54754 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ephb3P54754 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ephb3P54754 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ephb3P54754 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ephb3P54754 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ephb3P54754 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ephb3P54754 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ephb3P54754 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ephb3P54754 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ephb3P54754 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ephb3P54754 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ephb3P54754 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ephb3P54754 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ephb3P54754 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ephb3P54754 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ephb3P54754 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ephb3P54754 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ephb3P54754 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ephb3P54754 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ephb3P54754 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ephb3P54754 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ephb3P54754 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ephb3P54754 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ephb3P54754 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ephb3P54754 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ephb3P54754 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ephb3P54754 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ephb3P54754 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ephb3P54754 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ephb3P54754 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ephb3P54754 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ephb3P54754 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ephb3P54754 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ephb3P54754 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ephb3P54754 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ephb3P54754 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ephb3P54754 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ephb3P54754 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ephb3P54754 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ephb3P54754 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ephb3P54754 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ephb3P54754 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ephb3P54754 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ephb3P54754 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ephb3P54754 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ephb3P54754 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ephb3P54754 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ephb3P54754 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ephb3P54754 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ephb3P54754 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ephb3P54754 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ephb3P54754 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ephb3P54754 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ephb3P54754 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ephb3P54754 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ephb3P54754 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ephb3P54754 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ephb3P54754 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ephb3P54754 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ephb3P54754 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ephb3P54754 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ephb3P54754 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ephb3P54754 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ephb3P54754 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ephb3P54754 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ephb3P54754 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ephb3P54754 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ephb3P54754 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ephb3P54754 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ephb3P54754 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ephb3P54754 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ephb3P54754 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ephb3P54754 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ephb3P54754 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ephb3P54754 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ephb3P54754 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ephb3P54754 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ephb3P54754 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ephb3P54754 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ephb3P54754 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ephb3P54754 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ephb3P54754 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ephb3P54754 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ephb3P54754 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ephb3P54754 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ephb3P54754 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ephb3P54754 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ephb3P54754 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ephb3P54754 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ephb3P54754 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ephb3P54754 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ephb3P54754 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ephb3P54754 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ephb3P54754 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ephb3P54754 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ephb3P54754 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms