Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PitpnbP53811 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PitpnbP53811 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PitpnbP53811 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PitpnbP53811 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PitpnbP53811 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PitpnbP53811 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PitpnbP53811 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PitpnbP53811 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PitpnbP53811 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PitpnbP53811 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PitpnbP53811 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PitpnbP53811 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PitpnbP53811 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PitpnbP53811 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PitpnbP53811 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PitpnbP53811 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PitpnbP53811 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PitpnbP53811 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PitpnbP53811 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PitpnbP53811 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PitpnbP53811 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PitpnbP53811 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PitpnbP53811 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PitpnbP53811 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PitpnbP53811 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PitpnbP53811 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PitpnbP53811 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PitpnbP53811 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PitpnbP53811 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PitpnbP53811 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PitpnbP53811 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PitpnbP53811 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PitpnbP53811 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PitpnbP53811 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PitpnbP53811 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PitpnbP53811 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PitpnbP53811 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PitpnbP53811 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PitpnbP53811 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PitpnbP53811 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PitpnbP53811 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PitpnbP53811 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PitpnbP53811 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PitpnbP53811 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PitpnbP53811 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PitpnbP53811 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PitpnbP53811 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PitpnbP53811 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PitpnbP53811 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PitpnbP53811 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PitpnbP53811 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PitpnbP53811 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PitpnbP53811 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PitpnbP53811 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PitpnbP53811 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PitpnbP53811 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PitpnbP53811 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PitpnbP53811 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PitpnbP53811 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PitpnbP53811 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PitpnbP53811 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PitpnbP53811 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PitpnbP53811 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PitpnbP53811 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PitpnbP53811 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PitpnbP53811 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PitpnbP53811 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PitpnbP53811 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PitpnbP53811 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PitpnbP53811 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PitpnbP53811 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PitpnbP53811 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PitpnbP53811 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PitpnbP53811 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PitpnbP53811 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PitpnbP53811 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PitpnbP53811 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PitpnbP53811 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PitpnbP53811 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PitpnbP53811 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PitpnbP53811 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PitpnbP53811 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PitpnbP53811 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PitpnbP53811 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PitpnbP53811 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PitpnbP53811 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PitpnbP53811 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PitpnbP53811 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PitpnbP53811 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PitpnbP53811 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PitpnbP53811 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PitpnbP53811 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PitpnbP53811 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PitpnbP53811 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PitpnbP53811 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PitpnbP53811 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PitpnbP53811 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PitpnbP53811 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PitpnbP53811 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms