Protein–RNA interactions for Protein: P52482

Ube2e1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e1P52482 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ube2e1P52482 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ube2e1P52482 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ube2e1P52482 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ube2e1P52482 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2e1P52482 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2e1P52482 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2e1P52482 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2e1P52482 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2e1P52482 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2e1P52482 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2e1P52482 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2e1P52482 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2e1P52482 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2e1P52482 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2e1P52482 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ube2e1P52482 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ube2e1P52482 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ube2e1P52482 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ube2e1P52482 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ube2e1P52482 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2e1P52482 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2e1P52482 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2e1P52482 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2e1P52482 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2e1P52482 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ube2e1P52482 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ube2e1P52482 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ube2e1P52482 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ube2e1P52482 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ube2e1P52482 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2e1P52482 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2e1P52482 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2e1P52482 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2e1P52482 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2e1P52482 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2e1P52482 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2e1P52482 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2e1P52482 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2e1P52482 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2e1P52482 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2e1P52482 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2e1P52482 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2e1P52482 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2e1P52482 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2e1P52482 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2e1P52482 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2e1P52482 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2e1P52482 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2e1P52482 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2e1P52482 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2e1P52482 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2e1P52482 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ube2e1P52482 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ube2e1P52482 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2e1P52482 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2e1P52482 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2e1P52482 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2e1P52482 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2e1P52482 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2e1P52482 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2e1P52482 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2e1P52482 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2e1P52482 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2e1P52482 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2e1P52482 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2e1P52482 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2e1P52482 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2e1P52482 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2e1P52482 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2e1P52482 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2e1P52482 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2e1P52482 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2e1P52482 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2e1P52482 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2e1P52482 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2e1P52482 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ube2e1P52482 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ube2e1P52482 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ube2e1P52482 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ube2e1P52482 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ube2e1P52482 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ube2e1P52482 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ube2e1P52482 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ube2e1P52482 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ube2e1P52482 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ube2e1P52482 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ube2e1P52482 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ube2e1P52482 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ube2e1P52482 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ube2e1P52482 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ube2e1P52482 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ube2e1P52482 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ube2e1P52482 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ube2e1P52482 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ube2e1P52482 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ube2e1P52482 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ube2e1P52482 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ube2e1P52482 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ube2e1P52482 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms