Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LtbrP50284 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LtbrP50284 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LtbrP50284 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LtbrP50284 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LtbrP50284 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LtbrP50284 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LtbrP50284 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LtbrP50284 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LtbrP50284 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LtbrP50284 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LtbrP50284 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LtbrP50284 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LtbrP50284 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LtbrP50284 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LtbrP50284 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LtbrP50284 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LtbrP50284 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LtbrP50284 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LtbrP50284 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LtbrP50284 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LtbrP50284 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LtbrP50284 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LtbrP50284 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LtbrP50284 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LtbrP50284 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LtbrP50284 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LtbrP50284 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LtbrP50284 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LtbrP50284 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LtbrP50284 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LtbrP50284 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LtbrP50284 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LtbrP50284 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LtbrP50284 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LtbrP50284 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LtbrP50284 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LtbrP50284 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LtbrP50284 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LtbrP50284 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LtbrP50284 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LtbrP50284 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LtbrP50284 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LtbrP50284 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LtbrP50284 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LtbrP50284 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LtbrP50284 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LtbrP50284 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LtbrP50284 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LtbrP50284 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LtbrP50284 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LtbrP50284 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LtbrP50284 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LtbrP50284 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LtbrP50284 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LtbrP50284 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
LtbrP50284 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LtbrP50284 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LtbrP50284 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LtbrP50284 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LtbrP50284 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LtbrP50284 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LtbrP50284 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LtbrP50284 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LtbrP50284 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LtbrP50284 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LtbrP50284 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LtbrP50284 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LtbrP50284 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LtbrP50284 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LtbrP50284 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LtbrP50284 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LtbrP50284 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LtbrP50284 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LtbrP50284 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LtbrP50284 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LtbrP50284 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LtbrP50284 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LtbrP50284 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LtbrP50284 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LtbrP50284 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LtbrP50284 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LtbrP50284 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LtbrP50284 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LtbrP50284 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LtbrP50284 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LtbrP50284 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LtbrP50284 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LtbrP50284 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LtbrP50284 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LtbrP50284 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LtbrP50284 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LtbrP50284 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LtbrP50284 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
LtbrP50284 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
LtbrP50284 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LtbrP50284 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LtbrP50284 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LtbrP50284 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LtbrP50284 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.7 ms