Protein–RNA interactions for Protein: P48985

Atoh1, Protein atonal homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh1P48985 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atoh1P48985 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atoh1P48985 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Atoh1P48985 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atoh1P48985 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atoh1P48985 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atoh1P48985 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atoh1P48985 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atoh1P48985 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atoh1P48985 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atoh1P48985 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atoh1P48985 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atoh1P48985 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atoh1P48985 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atoh1P48985 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Atoh1P48985 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atoh1P48985 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atoh1P48985 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atoh1P48985 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Atoh1P48985 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atoh1P48985 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atoh1P48985 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atoh1P48985 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atoh1P48985 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Atoh1P48985 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atoh1P48985 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Atoh1P48985 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atoh1P48985 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atoh1P48985 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atoh1P48985 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atoh1P48985 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atoh1P48985 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atoh1P48985 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atoh1P48985 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atoh1P48985 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Atoh1P48985 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atoh1P48985 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atoh1P48985 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atoh1P48985 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atoh1P48985 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atoh1P48985 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atoh1P48985 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Atoh1P48985 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atoh1P48985 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atoh1P48985 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atoh1P48985 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atoh1P48985 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Atoh1P48985 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atoh1P48985 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Atoh1P48985 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atoh1P48985 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atoh1P48985 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atoh1P48985 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atoh1P48985 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atoh1P48985 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Atoh1P48985 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atoh1P48985 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atoh1P48985 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atoh1P48985 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atoh1P48985 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atoh1P48985 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atoh1P48985 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atoh1P48985 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atoh1P48985 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atoh1P48985 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atoh1P48985 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atoh1P48985 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atoh1P48985 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atoh1P48985 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atoh1P48985 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atoh1P48985 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atoh1P48985 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atoh1P48985 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Atoh1P48985 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atoh1P48985 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atoh1P48985 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atoh1P48985 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atoh1P48985 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atoh1P48985 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atoh1P48985 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atoh1P48985 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Atoh1P48985 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Atoh1P48985 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atoh1P48985 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atoh1P48985 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atoh1P48985 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atoh1P48985 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atoh1P48985 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atoh1P48985 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Atoh1P48985 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atoh1P48985 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atoh1P48985 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atoh1P48985 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atoh1P48985 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atoh1P48985 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atoh1P48985 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atoh1P48985 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atoh1P48985 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atoh1P48985 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atoh1P48985 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms