Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Rpl13P47963 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rpl13P47963 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rpl13P47963 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rpl13P47963 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rpl13P47963 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rpl13P47963 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rpl13P47963 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rpl13P47963 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rpl13P47963 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Rpl13P47963 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rpl13P47963 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rpl13P47963 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rpl13P47963 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rpl13P47963 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rpl13P47963 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rpl13P47963 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rpl13P47963 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rpl13P47963 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rpl13P47963 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rpl13P47963 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rpl13P47963 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rpl13P47963 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rpl13P47963 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rpl13P47963 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rpl13P47963 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rpl13P47963 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Rpl13P47963 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rpl13P47963 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rpl13P47963 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rpl13P47963 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rpl13P47963 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rpl13P47963 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rpl13P47963 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rpl13P47963 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rpl13P47963 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rpl13P47963 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rpl13P47963 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rpl13P47963 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rpl13P47963 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rpl13P47963 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rpl13P47963 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rpl13P47963 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rpl13P47963 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Rpl13P47963 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rpl13P47963 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rpl13P47963 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rpl13P47963 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rpl13P47963 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rpl13P47963 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rpl13P47963 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rpl13P47963 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rpl13P47963 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rpl13P47963 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rpl13P47963 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rpl13P47963 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rpl13P47963 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rpl13P47963 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rpl13P47963 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rpl13P47963 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rpl13P47963 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rpl13P47963 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rpl13P47963 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rpl13P47963 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rpl13P47963 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rpl13P47963 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rpl13P47963 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rpl13P47963 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rpl13P47963 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rpl13P47963 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rpl13P47963 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rpl13P47963 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rpl13P47963 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rpl13P47963 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Rpl13P47963 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rpl13P47963 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rpl13P47963 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpl13P47963 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpl13P47963 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpl13P47963 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpl13P47963 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpl13P47963 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpl13P47963 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rpl13P47963 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rpl13P47963 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rpl13P47963 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rpl13P47963 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rpl13P47963 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Rpl13P47963 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rpl13P47963 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rpl13P47963 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rpl13P47963 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rpl13P47963 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rpl13P47963 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rpl13P47963 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rpl13P47963 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rpl13P47963 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rpl13P47963 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rpl13P47963 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rpl13P47963 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms