Protein–RNA interactions for Protein: P47753

Capza1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza1P47753 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Capza1P47753 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Capza1P47753 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Capza1P47753 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Capza1P47753 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Capza1P47753 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Capza1P47753 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Capza1P47753 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Capza1P47753 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Capza1P47753 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Capza1P47753 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Capza1P47753 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Capza1P47753 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Capza1P47753 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Capza1P47753 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Capza1P47753 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Capza1P47753 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Capza1P47753 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Capza1P47753 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Capza1P47753 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Capza1P47753 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Capza1P47753 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Capza1P47753 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Capza1P47753 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Capza1P47753 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Capza1P47753 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Capza1P47753 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Capza1P47753 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Capza1P47753 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Capza1P47753 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Capza1P47753 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Capza1P47753 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Capza1P47753 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Capza1P47753 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Capza1P47753 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Capza1P47753 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Capza1P47753 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Capza1P47753 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Capza1P47753 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capza1P47753 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capza1P47753 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capza1P47753 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capza1P47753 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capza1P47753 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capza1P47753 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capza1P47753 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Capza1P47753 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Capza1P47753 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Capza1P47753 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Capza1P47753 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Capza1P47753 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capza1P47753 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capza1P47753 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capza1P47753 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capza1P47753 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Capza1P47753 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Capza1P47753 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Capza1P47753 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Capza1P47753 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Capza1P47753 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Capza1P47753 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Capza1P47753 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capza1P47753 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capza1P47753 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capza1P47753 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capza1P47753 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capza1P47753 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capza1P47753 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capza1P47753 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capza1P47753 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capza1P47753 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capza1P47753 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capza1P47753 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capza1P47753 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capza1P47753 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capza1P47753 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capza1P47753 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capza1P47753 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capza1P47753 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capza1P47753 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capza1P47753 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capza1P47753 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capza1P47753 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capza1P47753 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capza1P47753 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capza1P47753 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capza1P47753 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capza1P47753 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capza1P47753 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Capza1P47753 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capza1P47753 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capza1P47753 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capza1P47753 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capza1P47753 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capza1P47753 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capza1P47753 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capza1P47753 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capza1P47753 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capza1P47753 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capza1P47753 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms