Protein–RNA interactions for Protein: P43029

Gdf7, Growth/differentiation factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf7P43029 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Gdf7P43029 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Gdf7P43029 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Gdf7P43029 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gdf7P43029 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gdf7P43029 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gdf7P43029 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gdf7P43029 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gdf7P43029 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gdf7P43029 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gdf7P43029 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gdf7P43029 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gdf7P43029 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gdf7P43029 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Gdf7P43029 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Gdf7P43029 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gdf7P43029 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gdf7P43029 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gdf7P43029 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gdf7P43029 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Gdf7P43029 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gdf7P43029 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gdf7P43029 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gdf7P43029 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gdf7P43029 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gdf7P43029 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gdf7P43029 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gdf7P43029 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gdf7P43029 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gdf7P43029 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Gdf7P43029 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gdf7P43029 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gdf7P43029 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gdf7P43029 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gdf7P43029 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gdf7P43029 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gdf7P43029 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gdf7P43029 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gdf7P43029 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gdf7P43029 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gdf7P43029 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gdf7P43029 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gdf7P43029 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gdf7P43029 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gdf7P43029 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gdf7P43029 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gdf7P43029 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gdf7P43029 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gdf7P43029 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gdf7P43029 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gdf7P43029 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gdf7P43029 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gdf7P43029 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gdf7P43029 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gdf7P43029 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gdf7P43029 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gdf7P43029 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gdf7P43029 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gdf7P43029 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gdf7P43029 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gdf7P43029 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gdf7P43029 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gdf7P43029 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gdf7P43029 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gdf7P43029 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gdf7P43029 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gdf7P43029 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gdf7P43029 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gdf7P43029 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gdf7P43029 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gdf7P43029 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gdf7P43029 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gdf7P43029 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gdf7P43029 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gdf7P43029 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gdf7P43029 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gdf7P43029 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gdf7P43029 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gdf7P43029 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gdf7P43029 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gdf7P43029 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gdf7P43029 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gdf7P43029 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gdf7P43029 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gdf7P43029 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gdf7P43029 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gdf7P43029 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gdf7P43029 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gdf7P43029 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gdf7P43029 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gdf7P43029 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gdf7P43029 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gdf7P43029 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gdf7P43029 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gdf7P43029 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gdf7P43029 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gdf7P43029 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gdf7P43029 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gdf7P43029 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gdf7P43029 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.4 ms