Protein–RNA interactions for Protein: P42582

Nkx2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-5P42582 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nkx2-5P42582 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nkx2-5P42582 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nkx2-5P42582 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Nkx2-5P42582 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Nkx2-5P42582 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Nkx2-5P42582 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Nkx2-5P42582 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nkx2-5P42582 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nkx2-5P42582 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nkx2-5P42582 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nkx2-5P42582 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nkx2-5P42582 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nkx2-5P42582 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nkx2-5P42582 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nkx2-5P42582 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nkx2-5P42582 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nkx2-5P42582 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Nkx2-5P42582 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nkx2-5P42582 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nkx2-5P42582 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nkx2-5P42582 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nkx2-5P42582 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nkx2-5P42582 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nkx2-5P42582 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nkx2-5P42582 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nkx2-5P42582 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nkx2-5P42582 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nkx2-5P42582 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nkx2-5P42582 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nkx2-5P42582 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nkx2-5P42582 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nkx2-5P42582 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Nkx2-5P42582 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nkx2-5P42582 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nkx2-5P42582 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nkx2-5P42582 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nkx2-5P42582 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nkx2-5P42582 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nkx2-5P42582 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nkx2-5P42582 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nkx2-5P42582 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nkx2-5P42582 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nkx2-5P42582 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nkx2-5P42582 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nkx2-5P42582 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Nkx2-5P42582 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nkx2-5P42582 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nkx2-5P42582 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nkx2-5P42582 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nkx2-5P42582 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nkx2-5P42582 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nkx2-5P42582 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Nkx2-5P42582 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nkx2-5P42582 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nkx2-5P42582 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nkx2-5P42582 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nkx2-5P42582 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nkx2-5P42582 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nkx2-5P42582 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nkx2-5P42582 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nkx2-5P42582 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nkx2-5P42582 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nkx2-5P42582 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nkx2-5P42582 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nkx2-5P42582 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nkx2-5P42582 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nkx2-5P42582 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nkx2-5P42582 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nkx2-5P42582 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nkx2-5P42582 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nkx2-5P42582 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Nkx2-5P42582 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nkx2-5P42582 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nkx2-5P42582 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nkx2-5P42582 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nkx2-5P42582 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Nkx2-5P42582 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nkx2-5P42582 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nkx2-5P42582 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nkx2-5P42582 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nkx2-5P42582 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nkx2-5P42582 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nkx2-5P42582 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nkx2-5P42582 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nkx2-5P42582 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nkx2-5P42582 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nkx2-5P42582 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nkx2-5P42582 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nkx2-5P42582 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nkx2-5P42582 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nkx2-5P42582 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nkx2-5P42582 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nkx2-5P42582 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nkx2-5P42582 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nkx2-5P42582 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nkx2-5P42582 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nkx2-5P42582 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nkx2-5P42582 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nkx2-5P42582 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms