Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl28P41105 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl28P41105 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl28P41105 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl28P41105 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl28P41105 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl28P41105 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl28P41105 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl28P41105 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl28P41105 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl28P41105 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl28P41105 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl28P41105 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl28P41105 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl28P41105 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl28P41105 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl28P41105 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl28P41105 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl28P41105 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl28P41105 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl28P41105 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl28P41105 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl28P41105 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl28P41105 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl28P41105 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl28P41105 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl28P41105 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl28P41105 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl28P41105 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl28P41105 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl28P41105 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl28P41105 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl28P41105 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl28P41105 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl28P41105 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl28P41105 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl28P41105 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl28P41105 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl28P41105 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl28P41105 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl28P41105 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl28P41105 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl28P41105 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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