Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab23P35288 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab23P35288 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab23P35288 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab23P35288 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab23P35288 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab23P35288 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab23P35288 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab23P35288 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab23P35288 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab23P35288 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab23P35288 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab23P35288 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab23P35288 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab23P35288 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rab23P35288 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rab23P35288 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rab23P35288 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rab23P35288 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rab23P35288 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab23P35288 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab23P35288 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab23P35288 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab23P35288 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab23P35288 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab23P35288 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab23P35288 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab23P35288 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab23P35288 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab23P35288 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab23P35288 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab23P35288 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab23P35288 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab23P35288 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab23P35288 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab23P35288 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab23P35288 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rab23P35288 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rab23P35288 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rab23P35288 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rab23P35288 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rab23P35288 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rab23P35288 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rab23P35288 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rab23P35288 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rab23P35288 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rab23P35288 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab23P35288 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab23P35288 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab23P35288 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab23P35288 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab23P35288 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab23P35288 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rab23P35288 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rab23P35288 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rab23P35288 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rab23P35288 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rab23P35288 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab23P35288 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab23P35288 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab23P35288 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab23P35288 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab23P35288 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab23P35288 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab23P35288 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab23P35288 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab23P35288 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab23P35288 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab23P35288 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab23P35288 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rab23P35288 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rab23P35288 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rab23P35288 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rab23P35288 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rab23P35288 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab23P35288 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab23P35288 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab23P35288 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab23P35288 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab23P35288 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rab23P35288 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rab23P35288 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rab23P35288 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rab23P35288 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rab23P35288 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rab23P35288 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rab23P35288 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rab23P35288 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rab23P35288 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rab23P35288 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rab23P35288 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rab23P35288 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab23P35288 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab23P35288 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab23P35288 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab23P35288 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab23P35288 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab23P35288 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab23P35288 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab23P35288 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms