Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apoc1P34928 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apoc1P34928 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apoc1P34928 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Apoc1P34928 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Apoc1P34928 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Apoc1P34928 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Apoc1P34928 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apoc1P34928 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apoc1P34928 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apoc1P34928 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apoc1P34928 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apoc1P34928 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apoc1P34928 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apoc1P34928 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apoc1P34928 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apoc1P34928 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apoc1P34928 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apoc1P34928 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apoc1P34928 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apoc1P34928 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apoc1P34928 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apoc1P34928 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apoc1P34928 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apoc1P34928 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apoc1P34928 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apoc1P34928 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apoc1P34928 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apoc1P34928 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apoc1P34928 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apoc1P34928 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apoc1P34928 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Apoc1P34928 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Apoc1P34928 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Apoc1P34928 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Apoc1P34928 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apoc1P34928 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apoc1P34928 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apoc1P34928 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Apoc1P34928 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Apoc1P34928 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apoc1P34928 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apoc1P34928 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apoc1P34928 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apoc1P34928 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apoc1P34928 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apoc1P34928 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apoc1P34928 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apoc1P34928 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apoc1P34928 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apoc1P34928 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apoc1P34928 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Apoc1P34928 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Apoc1P34928 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Apoc1P34928 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Apoc1P34928 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Apoc1P34928 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Apoc1P34928 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Apoc1P34928 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apoc1P34928 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apoc1P34928 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apoc1P34928 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apoc1P34928 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apoc1P34928 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apoc1P34928 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apoc1P34928 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apoc1P34928 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apoc1P34928 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apoc1P34928 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apoc1P34928 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apoc1P34928 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apoc1P34928 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apoc1P34928 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apoc1P34928 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apoc1P34928 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apoc1P34928 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apoc1P34928 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apoc1P34928 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apoc1P34928 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apoc1P34928 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apoc1P34928 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apoc1P34928 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apoc1P34928 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apoc1P34928 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apoc1P34928 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apoc1P34928 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apoc1P34928 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apoc1P34928 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apoc1P34928 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apoc1P34928 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apoc1P34928 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apoc1P34928 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apoc1P34928 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apoc1P34928 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apoc1P34928 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apoc1P34928 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apoc1P34928 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apoc1P34928 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apoc1P34928 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apoc1P34928 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms