Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pabpc1P29341 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Pabpc1P29341 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pabpc1P29341 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Pabpc1P29341 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pabpc1P29341 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pabpc1P29341 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pabpc1P29341 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pabpc1P29341 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pabpc1P29341 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Pabpc1P29341 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pabpc1P29341 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pabpc1P29341 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pabpc1P29341 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pabpc1P29341 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pabpc1P29341 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pabpc1P29341 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pabpc1P29341 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pabpc1P29341 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Pabpc1P29341 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pabpc1P29341 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pabpc1P29341 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pabpc1P29341 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Pabpc1P29341 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Pabpc1P29341 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pabpc1P29341 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Pabpc1P29341 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Pabpc1P29341 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pabpc1P29341 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pabpc1P29341 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pabpc1P29341 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pabpc1P29341 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pabpc1P29341 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pabpc1P29341 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pabpc1P29341 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Pabpc1P29341 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pabpc1P29341 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pabpc1P29341 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pabpc1P29341 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pabpc1P29341 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pabpc1P29341 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pabpc1P29341 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pabpc1P29341 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Pabpc1P29341 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pabpc1P29341 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pabpc1P29341 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pabpc1P29341 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pabpc1P29341 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pabpc1P29341 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pabpc1P29341 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pabpc1P29341 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pabpc1P29341 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pabpc1P29341 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pabpc1P29341 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pabpc1P29341 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pabpc1P29341 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pabpc1P29341 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pabpc1P29341 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pabpc1P29341 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pabpc1P29341 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pabpc1P29341 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pabpc1P29341 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pabpc1P29341 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pabpc1P29341 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pabpc1P29341 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pabpc1P29341 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pabpc1P29341 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pabpc1P29341 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pabpc1P29341 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pabpc1P29341 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pabpc1P29341 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pabpc1P29341 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pabpc1P29341 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pabpc1P29341 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pabpc1P29341 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pabpc1P29341 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pabpc1P29341 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pabpc1P29341 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pabpc1P29341 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pabpc1P29341 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pabpc1P29341 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pabpc1P29341 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pabpc1P29341 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pabpc1P29341 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pabpc1P29341 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pabpc1P29341 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pabpc1P29341 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pabpc1P29341 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pabpc1P29341 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pabpc1P29341 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pabpc1P29341 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pabpc1P29341 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pabpc1P29341 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pabpc1P29341 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pabpc1P29341 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pabpc1P29341 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pabpc1P29341 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pabpc1P29341 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pabpc1P29341 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pabpc1P29341 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms