Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc6a9P28571 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc6a9P28571 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc6a9P28571 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc6a9P28571 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc6a9P28571 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc6a9P28571 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc6a9P28571 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc6a9P28571 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc6a9P28571 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Slc6a9P28571 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Slc6a9P28571 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc6a9P28571 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc6a9P28571 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc6a9P28571 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc6a9P28571 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc6a9P28571 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc6a9P28571 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc6a9P28571 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc6a9P28571 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc6a9P28571 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc6a9P28571 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc6a9P28571 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slc6a9P28571 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc6a9P28571 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc6a9P28571 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc6a9P28571 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc6a9P28571 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc6a9P28571 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc6a9P28571 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc6a9P28571 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc6a9P28571 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc6a9P28571 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc6a9P28571 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc6a9P28571 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc6a9P28571 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc6a9P28571 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc6a9P28571 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc6a9P28571 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc6a9P28571 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc6a9P28571 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc6a9P28571 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc6a9P28571 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc6a9P28571 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc6a9P28571 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc6a9P28571 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc6a9P28571 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc6a9P28571 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc6a9P28571 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc6a9P28571 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc6a9P28571 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc6a9P28571 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc6a9P28571 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc6a9P28571 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc6a9P28571 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc6a9P28571 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc6a9P28571 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc6a9P28571 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc6a9P28571 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc6a9P28571 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc6a9P28571 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc6a9P28571 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc6a9P28571 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc6a9P28571 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc6a9P28571 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc6a9P28571 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc6a9P28571 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc6a9P28571 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc6a9P28571 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc6a9P28571 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc6a9P28571 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc6a9P28571 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc6a9P28571 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc6a9P28571 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc6a9P28571 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc6a9P28571 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc6a9P28571 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc6a9P28571 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc6a9P28571 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc6a9P28571 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc6a9P28571 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc6a9P28571 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc6a9P28571 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc6a9P28571 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc6a9P28571 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc6a9P28571 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc6a9P28571 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc6a9P28571 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc6a9P28571 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc6a9P28571 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc6a9P28571 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc6a9P28571 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc6a9P28571 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc6a9P28571 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc6a9P28571 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc6a9P28571 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc6a9P28571 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc6a9P28571 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc6a9P28571 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc6a9P28571 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms