Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,53■□□□□ 0,24
Defa3P28310 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16,53■□□□□ 0,24
Defa3P28310 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC16,53■□□□□ 0,24
Defa3P28310 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16,53■□□□□ 0,24
Defa3P28310 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,52■□□□□ 0,24
Defa3P28310 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,52■□□□□ 0,24
Defa3P28310 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16,52■□□□□ 0,24
Defa3P28310 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,51■□□□□ 0,23
Defa3P28310 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,51■□□□□ 0,23
Defa3P28310 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,51■□□□□ 0,23
Defa3P28310 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,5■□□□□ 0,23
Defa3P28310 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16,5■□□□□ 0,23
Defa3P28310 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,5■□□□□ 0,23
Defa3P28310 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,49■□□□□ 0,23
Defa3P28310 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16,49■□□□□ 0,23
Defa3P28310 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16,49■□□□□ 0,23
Defa3P28310 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,49■□□□□ 0,23
Defa3P28310 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16,48■□□□□ 0,23
Defa3P28310 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,48■□□□□ 0,23
Defa3P28310 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16,47■□□□□ 0,23
Defa3P28310 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16,47■□□□□ 0,23
Defa3P28310 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16,47■□□□□ 0,23
Defa3P28310 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,46■□□□□ 0,23
Defa3P28310 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,46■□□□□ 0,23
Defa3P28310 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,46■□□□□ 0,23
Defa3P28310 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16,46■□□□□ 0,23
Defa3P28310 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16,46■□□□□ 0,22
Defa3P28310 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,45■□□□□ 0,22
Defa3P28310 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,45■□□□□ 0,22
Defa3P28310 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,44■□□□□ 0,22
Defa3P28310 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16,44■□□□□ 0,22
Defa3P28310 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16,44■□□□□ 0,22
Defa3P28310 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,44■□□□□ 0,22
Defa3P28310 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16,44■□□□□ 0,22
Defa3P28310 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,44■□□□□ 0,22
Defa3P28310 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16,43■□□□□ 0,22
Defa3P28310 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16,43■□□□□ 0,22
Defa3P28310 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,43■□□□□ 0,22
Defa3P28310 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,43■□□□□ 0,22
Defa3P28310 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,43■□□□□ 0,22
Defa3P28310 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,42■□□□□ 0,22
Defa3P28310 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,42■□□□□ 0,22
Defa3P28310 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,42■□□□□ 0,22
Defa3P28310 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16,42■□□□□ 0,22
Defa3P28310 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,42■□□□□ 0,22
Defa3P28310 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,42■□□□□ 0,22
Defa3P28310 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,41■□□□□ 0,22
Defa3P28310 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16,41■□□□□ 0,22
Defa3P28310 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16,4■□□□□ 0,22
Defa3P28310 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,4■□□□□ 0,22
Defa3P28310 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16,4■□□□□ 0,22
Defa3P28310 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,4■□□□□ 0,22
Defa3P28310 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16,4■□□□□ 0,22
Defa3P28310 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,39■□□□□ 0,22
Defa3P28310 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16,39■□□□□ 0,21
Defa3P28310 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16,39■□□□□ 0,21
Defa3P28310 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,39■□□□□ 0,21
Defa3P28310 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,39■□□□□ 0,21
Defa3P28310 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,39■□□□□ 0,21
Defa3P28310 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,38■□□□□ 0,21
Defa3P28310 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,38■□□□□ 0,21
Defa3P28310 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16,38■□□□□ 0,21
Defa3P28310 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,38■□□□□ 0,21
Defa3P28310 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,38■□□□□ 0,21
Defa3P28310 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16,38■□□□□ 0,21
Defa3P28310 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,37■□□□□ 0,21
Defa3P28310 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,37■□□□□ 0,21
Defa3P28310 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,37■□□□□ 0,21
Defa3P28310 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,37■□□□□ 0,21
Defa3P28310 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16,37■□□□□ 0,21
Defa3P28310 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,37■□□□□ 0,21
Defa3P28310 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,37■□□□□ 0,21
Defa3P28310 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,36■□□□□ 0,21
Defa3P28310 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,36■□□□□ 0,21
Defa3P28310 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,36■□□□□ 0,21
Defa3P28310 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,36■□□□□ 0,21
Defa3P28310 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16,36■□□□□ 0,21
Defa3P28310 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,36■□□□□ 0,21
Defa3P28310 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16,35■□□□□ 0,21
Defa3P28310 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,35■□□□□ 0,21
Defa3P28310 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,35■□□□□ 0,21
Defa3P28310 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16,35■□□□□ 0,21
Defa3P28310 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,35■□□□□ 0,21
Defa3P28310 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16,35■□□□□ 0,21
Defa3P28310 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,35■□□□□ 0,21
Defa3P28310 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,35■□□□□ 0,21
Defa3P28310 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16,34■□□□□ 0,21
Defa3P28310 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,34■□□□□ 0,21
Defa3P28310 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,34■□□□□ 0,21
Defa3P28310 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,34■□□□□ 0,21
Defa3P28310 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,34■□□□□ 0,21
Defa3P28310 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,34■□□□□ 0,21
Defa3P28310 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,34■□□□□ 0,21
Defa3P28310 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,34■□□□□ 0,21
Defa3P28310 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,34■□□□□ 0,21
Defa3P28310 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,34■□□□□ 0,21
Defa3P28310 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,34■□□□□ 0,21
Defa3P28310 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,33■□□□□ 0,21
Defa3P28310 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16,33■□□□□ 0,21
Defa3P28310 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,33■□□□□ 0,2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17,5 ms