Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
H2-DMaP28078 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
H2-DMaP28078 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
H2-DMaP28078 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
H2-DMaP28078 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
H2-DMaP28078 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
H2-DMaP28078 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
H2-DMaP28078 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
H2-DMaP28078 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
H2-DMaP28078 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
H2-DMaP28078 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
H2-DMaP28078 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
H2-DMaP28078 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
H2-DMaP28078 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
H2-DMaP28078 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
H2-DMaP28078 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
H2-DMaP28078 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
H2-DMaP28078 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
H2-DMaP28078 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
H2-DMaP28078 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
H2-DMaP28078 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
H2-DMaP28078 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
H2-DMaP28078 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
H2-DMaP28078 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
H2-DMaP28078 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
H2-DMaP28078 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
H2-DMaP28078 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
H2-DMaP28078 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
H2-DMaP28078 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
H2-DMaP28078 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
H2-DMaP28078 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
H2-DMaP28078 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
H2-DMaP28078 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
H2-DMaP28078 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
H2-DMaP28078 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
H2-DMaP28078 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
H2-DMaP28078 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
H2-DMaP28078 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
H2-DMaP28078 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
H2-DMaP28078 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
H2-DMaP28078 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
H2-DMaP28078 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
H2-DMaP28078 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
H2-DMaP28078 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
H2-DMaP28078 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
H2-DMaP28078 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
H2-DMaP28078 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
H2-DMaP28078 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
H2-DMaP28078 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
H2-DMaP28078 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
H2-DMaP28078 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
H2-DMaP28078 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
H2-DMaP28078 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
H2-DMaP28078 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
H2-DMaP28078 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
H2-DMaP28078 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
H2-DMaP28078 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
H2-DMaP28078 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
H2-DMaP28078 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
H2-DMaP28078 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
H2-DMaP28078 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
H2-DMaP28078 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
H2-DMaP28078 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
H2-DMaP28078 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
H2-DMaP28078 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
H2-DMaP28078 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
H2-DMaP28078 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
H2-DMaP28078 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
H2-DMaP28078 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
H2-DMaP28078 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
H2-DMaP28078 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
H2-DMaP28078 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
H2-DMaP28078 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
H2-DMaP28078 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
H2-DMaP28078 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
H2-DMaP28078 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
H2-DMaP28078 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
H2-DMaP28078 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
H2-DMaP28078 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
H2-DMaP28078 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
H2-DMaP28078 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
H2-DMaP28078 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
H2-DMaP28078 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
H2-DMaP28078 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
H2-DMaP28078 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
H2-DMaP28078 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
H2-DMaP28078 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
H2-DMaP28078 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
H2-DMaP28078 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
H2-DMaP28078 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
H2-DMaP28078 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
H2-DMaP28078 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
H2-DMaP28078 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
H2-DMaP28078 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
H2-DMaP28078 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
H2-DMaP28078 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
H2-DMaP28078 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
H2-DMaP28078 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
H2-DMaP28078 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
H2-DMaP28078 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.5 ms