Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PrkchP23298 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrkchP23298 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrkchP23298 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrkchP23298 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PrkchP23298 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PrkchP23298 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PrkchP23298 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PrkchP23298 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PrkchP23298 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PrkchP23298 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PrkchP23298 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PrkchP23298 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrkchP23298 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrkchP23298 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrkchP23298 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PrkchP23298 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PrkchP23298 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PrkchP23298 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PrkchP23298 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PrkchP23298 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PrkchP23298 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PrkchP23298 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PrkchP23298 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PrkchP23298 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PrkchP23298 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PrkchP23298 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PrkchP23298 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrkchP23298 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrkchP23298 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrkchP23298 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrkchP23298 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrkchP23298 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrkchP23298 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrkchP23298 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrkchP23298 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrkchP23298 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrkchP23298 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrkchP23298 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrkchP23298 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PrkchP23298 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrkchP23298 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrkchP23298 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrkchP23298 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrkchP23298 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrkchP23298 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PrkchP23298 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PrkchP23298 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PrkchP23298 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrkchP23298 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrkchP23298 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrkchP23298 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PrkchP23298 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PrkchP23298 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PrkchP23298 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PrkchP23298 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PrkchP23298 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PrkchP23298 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PrkchP23298 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PrkchP23298 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PrkchP23298 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PrkchP23298 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrkchP23298 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrkchP23298 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrkchP23298 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrkchP23298 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PrkchP23298 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PrkchP23298 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PrkchP23298 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PrkchP23298 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PrkchP23298 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrkchP23298 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrkchP23298 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrkchP23298 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PrkchP23298 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PrkchP23298 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PrkchP23298 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PrkchP23298 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PrkchP23298 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PrkchP23298 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PrkchP23298 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrkchP23298 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrkchP23298 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrkchP23298 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrkchP23298 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrkchP23298 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PrkchP23298 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PrkchP23298 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PrkchP23298 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PrkchP23298 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PrkchP23298 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PrkchP23298 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PrkchP23298 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PrkchP23298 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PrkchP23298 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PrkchP23298 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PrkchP23298 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PrkchP23298 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PrkchP23298 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PrkchP23298 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms