Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Eif3aP23116 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Eif3aP23116 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Eif3aP23116 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Eif3aP23116 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Eif3aP23116 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Eif3aP23116 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Eif3aP23116 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Eif3aP23116 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Eif3aP23116 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Eif3aP23116 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Eif3aP23116 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Eif3aP23116 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Eif3aP23116 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Eif3aP23116 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Eif3aP23116 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Eif3aP23116 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Eif3aP23116 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Eif3aP23116 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Eif3aP23116 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Eif3aP23116 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Eif3aP23116 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Eif3aP23116 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Eif3aP23116 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Eif3aP23116 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Eif3aP23116 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Eif3aP23116 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Eif3aP23116 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Eif3aP23116 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Eif3aP23116 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Eif3aP23116 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Eif3aP23116 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Eif3aP23116 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Eif3aP23116 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Eif3aP23116 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Eif3aP23116 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Eif3aP23116 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Eif3aP23116 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Eif3aP23116 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Eif3aP23116 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Eif3aP23116 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Eif3aP23116 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Eif3aP23116 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Eif3aP23116 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Eif3aP23116 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Eif3aP23116 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Eif3aP23116 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Eif3aP23116 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Eif3aP23116 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Eif3aP23116 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Eif3aP23116 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Eif3aP23116 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Eif3aP23116 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Eif3aP23116 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Eif3aP23116 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Eif3aP23116 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Eif3aP23116 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Eif3aP23116 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Eif3aP23116 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Eif3aP23116 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Eif3aP23116 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Eif3aP23116 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Eif3aP23116 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Eif3aP23116 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Eif3aP23116 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Eif3aP23116 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Eif3aP23116 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Eif3aP23116 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Eif3aP23116 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Eif3aP23116 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Eif3aP23116 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Eif3aP23116 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Eif3aP23116 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Eif3aP23116 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Eif3aP23116 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Eif3aP23116 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Eif3aP23116 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Eif3aP23116 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Eif3aP23116 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Eif3aP23116 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Eif3aP23116 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Eif3aP23116 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Eif3aP23116 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Eif3aP23116 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Eif3aP23116 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Eif3aP23116 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Eif3aP23116 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Eif3aP23116 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Eif3aP23116 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Eif3aP23116 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Eif3aP23116 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Eif3aP23116 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Eif3aP23116 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Eif3aP23116 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Eif3aP23116 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Eif3aP23116 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Eif3aP23116 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Eif3aP23116 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Eif3aP23116 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Eif3aP23116 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms