Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ms4a2P20490 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ms4a2P20490 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ms4a2P20490 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ms4a2P20490 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ms4a2P20490 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ms4a2P20490 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ms4a2P20490 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ms4a2P20490 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ms4a2P20490 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Ms4a2P20490 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ms4a2P20490 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ms4a2P20490 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ms4a2P20490 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ms4a2P20490 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ms4a2P20490 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ms4a2P20490 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ms4a2P20490 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ms4a2P20490 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ms4a2P20490 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ms4a2P20490 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ms4a2P20490 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ms4a2P20490 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ms4a2P20490 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ms4a2P20490 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ms4a2P20490 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ms4a2P20490 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ms4a2P20490 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ms4a2P20490 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ms4a2P20490 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ms4a2P20490 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ms4a2P20490 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ms4a2P20490 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ms4a2P20490 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ms4a2P20490 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ms4a2P20490 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ms4a2P20490 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ms4a2P20490 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ms4a2P20490 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ms4a2P20490 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ms4a2P20490 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ms4a2P20490 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ms4a2P20490 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ms4a2P20490 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ms4a2P20490 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ms4a2P20490 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ms4a2P20490 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ms4a2P20490 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ms4a2P20490 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ms4a2P20490 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ms4a2P20490 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ms4a2P20490 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ms4a2P20490 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ms4a2P20490 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ms4a2P20490 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ms4a2P20490 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ms4a2P20490 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ms4a2P20490 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ms4a2P20490 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ms4a2P20490 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ms4a2P20490 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ms4a2P20490 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ms4a2P20490 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ms4a2P20490 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ms4a2P20490 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ms4a2P20490 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ms4a2P20490 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ms4a2P20490 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Ms4a2P20490 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ms4a2P20490 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ms4a2P20490 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Ms4a2P20490 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ms4a2P20490 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ms4a2P20490 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ms4a2P20490 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ms4a2P20490 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ms4a2P20490 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ms4a2P20490 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ms4a2P20490 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ms4a2P20490 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ms4a2P20490 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ms4a2P20490 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ms4a2P20490 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ms4a2P20490 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ms4a2P20490 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ms4a2P20490 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ms4a2P20490 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ms4a2P20490 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ms4a2P20490 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ms4a2P20490 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ms4a2P20490 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ms4a2P20490 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ms4a2P20490 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ms4a2P20490 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ms4a2P20490 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ms4a2P20490 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ms4a2P20490 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ms4a2P20490 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ms4a2P20490 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ms4a2P20490 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms