Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrkcaP20444 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrkcaP20444 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrkcaP20444 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrkcaP20444 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrkcaP20444 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrkcaP20444 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrkcaP20444 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrkcaP20444 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrkcaP20444 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrkcaP20444 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrkcaP20444 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrkcaP20444 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrkcaP20444 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PrkcaP20444 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PrkcaP20444 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PrkcaP20444 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PrkcaP20444 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PrkcaP20444 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkcaP20444 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkcaP20444 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkcaP20444 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkcaP20444 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkcaP20444 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkcaP20444 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkcaP20444 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrkcaP20444 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrkcaP20444 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrkcaP20444 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrkcaP20444 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrkcaP20444 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrkcaP20444 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrkcaP20444 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrkcaP20444 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrkcaP20444 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrkcaP20444 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrkcaP20444 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PrkcaP20444 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PrkcaP20444 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrkcaP20444 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrkcaP20444 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PrkcaP20444 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrkcaP20444 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrkcaP20444 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrkcaP20444 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrkcaP20444 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrkcaP20444 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PrkcaP20444 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PrkcaP20444 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PrkcaP20444 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PrkcaP20444 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PrkcaP20444 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PrkcaP20444 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PrkcaP20444 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PrkcaP20444 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PrkcaP20444 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PrkcaP20444 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PrkcaP20444 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PrkcaP20444 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PrkcaP20444 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PrkcaP20444 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PrkcaP20444 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PrkcaP20444 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PrkcaP20444 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PrkcaP20444 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PrkcaP20444 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PrkcaP20444 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PrkcaP20444 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PrkcaP20444 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PrkcaP20444 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PrkcaP20444 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PrkcaP20444 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PrkcaP20444 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PrkcaP20444 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PrkcaP20444 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PrkcaP20444 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PrkcaP20444 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PrkcaP20444 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PrkcaP20444 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PrkcaP20444 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PrkcaP20444 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PrkcaP20444 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PrkcaP20444 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PrkcaP20444 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PrkcaP20444 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PrkcaP20444 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PrkcaP20444 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PrkcaP20444 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PrkcaP20444 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PrkcaP20444 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PrkcaP20444 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PrkcaP20444 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PrkcaP20444 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PrkcaP20444 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PrkcaP20444 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PrkcaP20444 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PrkcaP20444 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PrkcaP20444 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PrkcaP20444 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PrkcaP20444 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms