Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NelfeP19426 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NelfeP19426 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NelfeP19426 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NelfeP19426 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NelfeP19426 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NelfeP19426 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NelfeP19426 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NelfeP19426 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NelfeP19426 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NelfeP19426 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NelfeP19426 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NelfeP19426 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NelfeP19426 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NelfeP19426 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NelfeP19426 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NelfeP19426 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NelfeP19426 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NelfeP19426 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NelfeP19426 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NelfeP19426 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NelfeP19426 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NelfeP19426 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NelfeP19426 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NelfeP19426 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NelfeP19426 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NelfeP19426 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NelfeP19426 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NelfeP19426 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NelfeP19426 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NelfeP19426 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NelfeP19426 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NelfeP19426 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NelfeP19426 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NelfeP19426 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NelfeP19426 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NelfeP19426 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NelfeP19426 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NelfeP19426 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NelfeP19426 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NelfeP19426 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NelfeP19426 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NelfeP19426 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NelfeP19426 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NelfeP19426 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NelfeP19426 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NelfeP19426 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NelfeP19426 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NelfeP19426 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NelfeP19426 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NelfeP19426 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NelfeP19426 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NelfeP19426 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NelfeP19426 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NelfeP19426 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NelfeP19426 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NelfeP19426 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NelfeP19426 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NelfeP19426 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NelfeP19426 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NelfeP19426 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NelfeP19426 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NelfeP19426 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NelfeP19426 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NelfeP19426 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NelfeP19426 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NelfeP19426 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NelfeP19426 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NelfeP19426 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NelfeP19426 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NelfeP19426 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NelfeP19426 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NelfeP19426 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
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