Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cd44P15379 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cd44P15379 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cd44P15379 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cd44P15379 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cd44P15379 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cd44P15379 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cd44P15379 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cd44P15379 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cd44P15379 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cd44P15379 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cd44P15379 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cd44P15379 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cd44P15379 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cd44P15379 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cd44P15379 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cd44P15379 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cd44P15379 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cd44P15379 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cd44P15379 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cd44P15379 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cd44P15379 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cd44P15379 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cd44P15379 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cd44P15379 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cd44P15379 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cd44P15379 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cd44P15379 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cd44P15379 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cd44P15379 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cd44P15379 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cd44P15379 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cd44P15379 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cd44P15379 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cd44P15379 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cd44P15379 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cd44P15379 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cd44P15379 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cd44P15379 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cd44P15379 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cd44P15379 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cd44P15379 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cd44P15379 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cd44P15379 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cd44P15379 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cd44P15379 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cd44P15379 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cd44P15379 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cd44P15379 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cd44P15379 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cd44P15379 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cd44P15379 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cd44P15379 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cd44P15379 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cd44P15379 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cd44P15379 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cd44P15379 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd44P15379 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd44P15379 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cd44P15379 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cd44P15379 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cd44P15379 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cd44P15379 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cd44P15379 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cd44P15379 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cd44P15379 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cd44P15379 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cd44P15379 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cd44P15379 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cd44P15379 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cd44P15379 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cd44P15379 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cd44P15379 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd44P15379 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd44P15379 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd44P15379 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cd44P15379 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cd44P15379 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cd44P15379 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cd44P15379 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cd44P15379 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd44P15379 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd44P15379 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd44P15379 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd44P15379 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd44P15379 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd44P15379 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd44P15379 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd44P15379 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd44P15379 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd44P15379 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd44P15379 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cd44P15379 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cd44P15379 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cd44P15379 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cd44P15379 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd44P15379 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd44P15379 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd44P15379 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd44P15379 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms