Protein–RNA interactions for Protein: P14431

H2-Q9, H-2 class I histocompatibility antigen, Q9 alpha chain (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q9P14431 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2-Q9P14431 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2-Q9P14431 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2-Q9P14431 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2-Q9P14431 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
H2-Q9P14431 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2-Q9P14431 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2-Q9P14431 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
H2-Q9P14431 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
H2-Q9P14431 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
H2-Q9P14431 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
H2-Q9P14431 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H2-Q9P14431 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2-Q9P14431 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
H2-Q9P14431 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2-Q9P14431 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2-Q9P14431 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2-Q9P14431 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2-Q9P14431 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2-Q9P14431 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
H2-Q9P14431 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
H2-Q9P14431 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2-Q9P14431 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2-Q9P14431 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2-Q9P14431 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2-Q9P14431 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2-Q9P14431 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2-Q9P14431 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2-Q9P14431 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2-Q9P14431 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2-Q9P14431 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
H2-Q9P14431 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2-Q9P14431 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2-Q9P14431 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2-Q9P14431 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
H2-Q9P14431 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2-Q9P14431 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2-Q9P14431 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2-Q9P14431 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2-Q9P14431 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
H2-Q9P14431 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2-Q9P14431 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2-Q9P14431 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-Q9P14431 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-Q9P14431 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-Q9P14431 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-Q9P14431 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-Q9P14431 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-Q9P14431 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-Q9P14431 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2-Q9P14431 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2-Q9P14431 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2-Q9P14431 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2-Q9P14431 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2-Q9P14431 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2-Q9P14431 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2-Q9P14431 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
H2-Q9P14431 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2-Q9P14431 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2-Q9P14431 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2-Q9P14431 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2-Q9P14431 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2-Q9P14431 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2-Q9P14431 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2-Q9P14431 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
H2-Q9P14431 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2-Q9P14431 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2-Q9P14431 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2-Q9P14431 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
H2-Q9P14431 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2-Q9P14431 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2-Q9P14431 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2-Q9P14431 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-Q9P14431 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-Q9P14431 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-Q9P14431 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-Q9P14431 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-Q9P14431 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-Q9P14431 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2-Q9P14431 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2-Q9P14431 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2-Q9P14431 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2-Q9P14431 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
H2-Q9P14431 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2-Q9P14431 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
H2-Q9P14431 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2-Q9P14431 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2-Q9P14431 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2-Q9P14431 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2-Q9P14431 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2-Q9P14431 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2-Q9P14431 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2-Q9P14431 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2-Q9P14431 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2-Q9P14431 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2-Q9P14431 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2-Q9P14431 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2-Q9P14431 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2-Q9P14431 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2-Q9P14431 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms