Protein–RNA interactions for Protein: P14097

Ccl4, C-C motif chemokine 4, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl4P14097 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccl4P14097 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccl4P14097 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccl4P14097 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccl4P14097 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccl4P14097 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccl4P14097 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccl4P14097 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccl4P14097 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccl4P14097 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccl4P14097 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccl4P14097 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccl4P14097 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccl4P14097 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccl4P14097 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccl4P14097 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccl4P14097 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccl4P14097 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccl4P14097 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccl4P14097 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccl4P14097 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccl4P14097 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccl4P14097 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccl4P14097 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccl4P14097 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccl4P14097 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccl4P14097 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccl4P14097 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccl4P14097 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccl4P14097 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccl4P14097 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccl4P14097 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccl4P14097 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccl4P14097 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccl4P14097 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccl4P14097 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccl4P14097 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccl4P14097 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccl4P14097 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccl4P14097 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccl4P14097 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccl4P14097 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccl4P14097 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccl4P14097 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccl4P14097 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccl4P14097 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccl4P14097 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccl4P14097 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccl4P14097 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccl4P14097 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccl4P14097 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccl4P14097 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccl4P14097 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccl4P14097 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccl4P14097 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccl4P14097 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccl4P14097 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccl4P14097 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccl4P14097 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccl4P14097 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccl4P14097 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccl4P14097 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccl4P14097 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccl4P14097 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccl4P14097 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccl4P14097 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccl4P14097 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccl4P14097 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccl4P14097 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccl4P14097 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Ccl4P14097 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccl4P14097 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccl4P14097 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccl4P14097 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccl4P14097 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccl4P14097 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccl4P14097 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccl4P14097 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccl4P14097 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccl4P14097 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccl4P14097 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccl4P14097 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccl4P14097 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccl4P14097 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccl4P14097 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccl4P14097 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccl4P14097 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccl4P14097 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccl4P14097 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccl4P14097 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccl4P14097 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccl4P14097 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccl4P14097 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccl4P14097 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccl4P14097 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccl4P14097 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccl4P14097 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccl4P14097 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccl4P14097 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccl4P14097 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.7 ms