Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr4a1P12813 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr4a1P12813 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr4a1P12813 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr4a1P12813 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr4a1P12813 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr4a1P12813 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr4a1P12813 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr4a1P12813 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nr4a1P12813 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nr4a1P12813 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr4a1P12813 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr4a1P12813 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr4a1P12813 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr4a1P12813 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr4a1P12813 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr4a1P12813 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr4a1P12813 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr4a1P12813 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr4a1P12813 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr4a1P12813 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr4a1P12813 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr4a1P12813 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr4a1P12813 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr4a1P12813 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr4a1P12813 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr4a1P12813 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr4a1P12813 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr4a1P12813 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr4a1P12813 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr4a1P12813 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr4a1P12813 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr4a1P12813 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr4a1P12813 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr4a1P12813 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr4a1P12813 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr4a1P12813 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr4a1P12813 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr4a1P12813 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr4a1P12813 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr4a1P12813 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr4a1P12813 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr4a1P12813 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr4a1P12813 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr4a1P12813 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr4a1P12813 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr4a1P12813 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr4a1P12813 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr4a1P12813 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr4a1P12813 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr4a1P12813 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr4a1P12813 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr4a1P12813 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr4a1P12813 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr4a1P12813 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Nr4a1P12813 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Nr4a1P12813 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nr4a1P12813 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nr4a1P12813 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nr4a1P12813 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr4a1P12813 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr4a1P12813 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr4a1P12813 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr4a1P12813 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr4a1P12813 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr4a1P12813 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr4a1P12813 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr4a1P12813 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr4a1P12813 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr4a1P12813 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nr4a1P12813 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nr4a1P12813 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nr4a1P12813 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr4a1P12813 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr4a1P12813 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr4a1P12813 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr4a1P12813 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr4a1P12813 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr4a1P12813 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr4a1P12813 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr4a1P12813 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nr4a1P12813 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nr4a1P12813 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nr4a1P12813 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nr4a1P12813 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nr4a1P12813 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr4a1P12813 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr4a1P12813 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr4a1P12813 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Nr4a1P12813 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Nr4a1P12813 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nr4a1P12813 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nr4a1P12813 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nr4a1P12813 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nr4a1P12813 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nr4a1P12813 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nr4a1P12813 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nr4a1P12813 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nr4a1P12813 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nr4a1P12813 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms