Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Calb1P12658 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Calb1P12658 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Calb1P12658 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Calb1P12658 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Calb1P12658 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Calb1P12658 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Calb1P12658 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Calb1P12658 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Calb1P12658 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Calb1P12658 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Calb1P12658 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Calb1P12658 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Calb1P12658 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Calb1P12658 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Calb1P12658 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Calb1P12658 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Calb1P12658 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Calb1P12658 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Calb1P12658 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Calb1P12658 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Calb1P12658 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Calb1P12658 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Calb1P12658 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Calb1P12658 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Calb1P12658 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Calb1P12658 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Calb1P12658 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Calb1P12658 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Calb1P12658 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Calb1P12658 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Calb1P12658 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Calb1P12658 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Calb1P12658 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Calb1P12658 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Calb1P12658 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Calb1P12658 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Calb1P12658 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Calb1P12658 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Calb1P12658 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Calb1P12658 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Calb1P12658 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Calb1P12658 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Calb1P12658 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Calb1P12658 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Calb1P12658 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Calb1P12658 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Calb1P12658 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Calb1P12658 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Calb1P12658 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Calb1P12658 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Calb1P12658 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Calb1P12658 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Calb1P12658 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Calb1P12658 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Calb1P12658 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Calb1P12658 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Calb1P12658 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Calb1P12658 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Calb1P12658 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Calb1P12658 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Calb1P12658 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Calb1P12658 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Calb1P12658 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Calb1P12658 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Calb1P12658 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Calb1P12658 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Calb1P12658 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Calb1P12658 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Calb1P12658 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Calb1P12658 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Calb1P12658 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Calb1P12658 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Calb1P12658 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Calb1P12658 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Calb1P12658 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Calb1P12658 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Calb1P12658 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Calb1P12658 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Calb1P12658 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Calb1P12658 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Calb1P12658 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Calb1P12658 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Calb1P12658 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Calb1P12658 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Calb1P12658 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Calb1P12658 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Calb1P12658 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Calb1P12658 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Calb1P12658 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Calb1P12658 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Calb1P12658 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Calb1P12658 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Calb1P12658 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Calb1P12658 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Calb1P12658 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Calb1P12658 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Calb1P12658 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Calb1P12658 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Calb1P12658 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms