Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nid1P10493 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nid1P10493 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nid1P10493 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nid1P10493 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nid1P10493 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nid1P10493 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nid1P10493 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nid1P10493 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nid1P10493 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nid1P10493 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nid1P10493 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nid1P10493 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nid1P10493 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nid1P10493 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nid1P10493 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nid1P10493 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nid1P10493 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nid1P10493 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nid1P10493 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nid1P10493 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nid1P10493 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nid1P10493 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nid1P10493 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nid1P10493 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nid1P10493 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nid1P10493 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nid1P10493 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nid1P10493 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nid1P10493 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nid1P10493 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nid1P10493 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nid1P10493 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nid1P10493 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nid1P10493 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nid1P10493 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nid1P10493 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nid1P10493 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nid1P10493 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nid1P10493 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nid1P10493 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nid1P10493 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nid1P10493 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nid1P10493 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nid1P10493 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nid1P10493 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nid1P10493 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nid1P10493 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nid1P10493 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nid1P10493 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nid1P10493 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nid1P10493 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nid1P10493 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nid1P10493 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nid1P10493 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nid1P10493 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nid1P10493 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nid1P10493 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nid1P10493 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nid1P10493 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nid1P10493 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nid1P10493 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nid1P10493 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nid1P10493 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nid1P10493 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nid1P10493 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nid1P10493 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nid1P10493 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nid1P10493 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nid1P10493 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nid1P10493 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nid1P10493 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nid1P10493 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nid1P10493 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nid1P10493 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nid1P10493 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nid1P10493 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nid1P10493 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nid1P10493 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nid1P10493 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nid1P10493 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nid1P10493 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nid1P10493 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nid1P10493 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nid1P10493 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Nid1P10493 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nid1P10493 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nid1P10493 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nid1P10493 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nid1P10493 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nid1P10493 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Nid1P10493 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nid1P10493 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nid1P10493 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nid1P10493 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nid1P10493 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nid1P10493 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nid1P10493 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nid1P10493 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nid1P10493 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms