Protein–RNA interactions for Protein: P10146

Ccl1, C-C motif chemokine 1, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl1P10146 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl1P10146 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl1P10146 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl1P10146 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl1P10146 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl1P10146 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl1P10146 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl1P10146 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl1P10146 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl1P10146 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl1P10146 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl1P10146 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl1P10146 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl1P10146 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl1P10146 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl1P10146 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl1P10146 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl1P10146 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl1P10146 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl1P10146 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl1P10146 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccl1P10146 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl1P10146 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl1P10146 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl1P10146 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl1P10146 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl1P10146 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl1P10146 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl1P10146 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl1P10146 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl1P10146 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl1P10146 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl1P10146 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl1P10146 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl1P10146 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl1P10146 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl1P10146 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl1P10146 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl1P10146 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl1P10146 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl1P10146 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl1P10146 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccl1P10146 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccl1P10146 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccl1P10146 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccl1P10146 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccl1P10146 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccl1P10146 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccl1P10146 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccl1P10146 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccl1P10146 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl1P10146 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl1P10146 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl1P10146 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl1P10146 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl1P10146 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl1P10146 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccl1P10146 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccl1P10146 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccl1P10146 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccl1P10146 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccl1P10146 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccl1P10146 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccl1P10146 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl1P10146 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl1P10146 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl1P10146 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl1P10146 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl1P10146 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl1P10146 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl1P10146 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl1P10146 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccl1P10146 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccl1P10146 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccl1P10146 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccl1P10146 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccl1P10146 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccl1P10146 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccl1P10146 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccl1P10146 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccl1P10146 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl1P10146 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl1P10146 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl1P10146 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl1P10146 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl1P10146 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl1P10146 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl1P10146 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl1P10146 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl1P10146 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl1P10146 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl1P10146 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl1P10146 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl1P10146 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl1P10146 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl1P10146 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl1P10146 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl1P10146 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl1P10146 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl1P10146 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms