Protein–RNA interactions for Protein: P0DP60

Lynx1, Ly-6/neurotoxin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lynx1P0DP60 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lynx1P0DP60 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lynx1P0DP60 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lynx1P0DP60 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lynx1P0DP60 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lynx1P0DP60 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lynx1P0DP60 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lynx1P0DP60 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lynx1P0DP60 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lynx1P0DP60 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lynx1P0DP60 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lynx1P0DP60 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lynx1P0DP60 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lynx1P0DP60 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lynx1P0DP60 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lynx1P0DP60 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lynx1P0DP60 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lynx1P0DP60 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lynx1P0DP60 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lynx1P0DP60 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lynx1P0DP60 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lynx1P0DP60 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lynx1P0DP60 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lynx1P0DP60 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lynx1P0DP60 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lynx1P0DP60 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lynx1P0DP60 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lynx1P0DP60 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lynx1P0DP60 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lynx1P0DP60 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lynx1P0DP60 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lynx1P0DP60 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lynx1P0DP60 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lynx1P0DP60 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lynx1P0DP60 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lynx1P0DP60 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lynx1P0DP60 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lynx1P0DP60 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lynx1P0DP60 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lynx1P0DP60 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lynx1P0DP60 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lynx1P0DP60 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lynx1P0DP60 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lynx1P0DP60 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lynx1P0DP60 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lynx1P0DP60 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lynx1P0DP60 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lynx1P0DP60 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lynx1P0DP60 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lynx1P0DP60 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lynx1P0DP60 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lynx1P0DP60 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lynx1P0DP60 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lynx1P0DP60 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lynx1P0DP60 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lynx1P0DP60 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lynx1P0DP60 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lynx1P0DP60 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lynx1P0DP60 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lynx1P0DP60 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lynx1P0DP60 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lynx1P0DP60 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lynx1P0DP60 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lynx1P0DP60 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lynx1P0DP60 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lynx1P0DP60 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lynx1P0DP60 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lynx1P0DP60 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lynx1P0DP60 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lynx1P0DP60 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lynx1P0DP60 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lynx1P0DP60 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lynx1P0DP60 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lynx1P0DP60 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lynx1P0DP60 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lynx1P0DP60 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lynx1P0DP60 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lynx1P0DP60 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lynx1P0DP60 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lynx1P0DP60 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lynx1P0DP60 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lynx1P0DP60 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lynx1P0DP60 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lynx1P0DP60 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lynx1P0DP60 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lynx1P0DP60 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lynx1P0DP60 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lynx1P0DP60 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lynx1P0DP60 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lynx1P0DP60 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lynx1P0DP60 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lynx1P0DP60 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lynx1P0DP60 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lynx1P0DP60 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lynx1P0DP60 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lynx1P0DP60 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lynx1P0DP60 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lynx1P0DP60 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lynx1P0DP60 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lynx1P0DP60 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms