Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ifna4P07351 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifna4P07351 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifna4P07351 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifna4P07351 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifna4P07351 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifna4P07351 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ifna4P07351 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ifna4P07351 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ifna4P07351 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ifna4P07351 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ifna4P07351 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ifna4P07351 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ifna4P07351 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ifna4P07351 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ifna4P07351 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ifna4P07351 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ifna4P07351 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ifna4P07351 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ifna4P07351 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ifna4P07351 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ifna4P07351 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifna4P07351 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifna4P07351 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifna4P07351 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifna4P07351 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ifna4P07351 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ifna4P07351 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ifna4P07351 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ifna4P07351 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ifna4P07351 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ifna4P07351 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ifna4P07351 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ifna4P07351 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ifna4P07351 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ifna4P07351 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ifna4P07351 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ifna4P07351 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ifna4P07351 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ifna4P07351 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ifna4P07351 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ifna4P07351 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifna4P07351 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifna4P07351 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifna4P07351 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifna4P07351 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifna4P07351 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifna4P07351 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifna4P07351 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifna4P07351 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifna4P07351 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifna4P07351 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifna4P07351 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifna4P07351 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifna4P07351 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifna4P07351 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifna4P07351 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifna4P07351 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifna4P07351 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifna4P07351 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifna4P07351 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifna4P07351 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifna4P07351 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifna4P07351 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifna4P07351 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifna4P07351 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifna4P07351 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifna4P07351 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifna4P07351 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifna4P07351 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifna4P07351 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifna4P07351 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifna4P07351 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifna4P07351 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifna4P07351 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifna4P07351 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifna4P07351 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifna4P07351 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifna4P07351 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifna4P07351 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifna4P07351 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ifna4P07351 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ifna4P07351 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ifna4P07351 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ifna4P07351 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ifna4P07351 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ifna4P07351 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ifna4P07351 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ifna4P07351 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ifna4P07351 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ifna4P07351 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ifna4P07351 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ifna4P07351 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ifna4P07351 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ifna4P07351 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ifna4P07351 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ifna4P07351 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ifna4P07351 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ifna4P07351 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ifna4P07351 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms