Protein–RNA interactions for Protein: P01853

T-cell receptor gamma chain C region C10.5, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01853 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01853 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01853 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01853 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01853 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01853 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01853 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01853 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01853 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01853 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01853 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
P01853 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01853 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01853 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01853 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01853 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01853 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
P01853 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
P01853 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
P01853 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
P01853 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
P01853 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
P01853 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
P01853 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
P01853 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
P01853 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
P01853 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
P01853 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
P01853 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
P01853 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
P01853 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
P01853 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
P01853 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
P01853 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
P01853 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
P01853 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
P01853 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
P01853 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P01853 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P01853 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
P01853 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P01853 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P01853 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P01853 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
P01853 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P01853 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01853 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01853 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01853 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01853 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01853 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01853 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
P01853 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01853 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01853 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01853 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01853 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01853 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01853 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01853 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01853 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01853 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
P01853 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P01853 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
P01853 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P01853 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
P01853 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01853 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01853 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01853 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01853 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01853 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01853 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01853 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01853 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01853 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01853 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01853 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01853 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01853 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01853 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
P01853 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
P01853 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
P01853 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
P01853 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
P01853 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
P01853 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
P01853 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
P01853 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
P01853 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01853 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01853 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01853 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01853 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01853 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01853 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01853 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01853 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01853 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01853 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms