Protein–RNA interactions for Protein: P01823

Ig heavy chain V region 36-60, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01823 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01823 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01823 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01823 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01823 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01823 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01823 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01823 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01823 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01823 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01823 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01823 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01823 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01823 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01823 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01823 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01823 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01823 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01823 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01823 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01823 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01823 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01823 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01823 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01823 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01823 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01823 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01823 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01823 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01823 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01823 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01823 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01823 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01823 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01823 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01823 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P01823 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01823 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01823 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01823 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P01823 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01823 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01823 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01823 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01823 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01823 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01823 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01823 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01823 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01823 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01823 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01823 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01823 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01823 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01823 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01823 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01823 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01823 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01823 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01823 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01823 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01823 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01823 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01823 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01823 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01823 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01823 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01823 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01823 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01823 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01823 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01823 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01823 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01823 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01823 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01823 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01823 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01823 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01823 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01823 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01823 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01823 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01823 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01823 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01823 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01823 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01823 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01823 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01823 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01823 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01823 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01823 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01823 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01823 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01823 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01823 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01823 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01823 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01823 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01823 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms