Protein–RNA interactions for Protein: P01757

Ig heavy chain V region J558, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01757 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01757 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01757 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01757 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01757 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01757 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01757 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01757 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01757 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01757 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01757 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01757 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01757 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01757 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01757 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01757 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01757 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01757 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01757 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01757 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01757 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01757 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01757 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01757 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01757 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01757 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01757 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01757 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01757 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01757 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01757 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01757 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01757 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01757 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01757 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01757 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01757 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01757 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01757 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01757 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01757 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01757 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01757 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01757 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01757 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01757 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01757 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01757 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01757 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01757 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01757 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01757 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01757 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01757 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01757 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
P01757 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01757 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01757 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01757 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01757 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01757 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01757 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01757 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01757 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01757 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01757 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01757 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01757 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01757 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01757 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
P01757 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01757 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01757 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01757 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01757 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01757 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01757 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01757 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01757 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01757 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01757 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01757 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01757 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01757 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01757 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01757 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01757 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01757 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01757 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01757 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01757 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01757 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01757 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
P01757 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P01757 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
P01757 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
P01757 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
P01757 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P01757 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P01757 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms