Protein–RNA interactions for Protein: P01741

Ig heavy chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01741 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
P01741 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01741 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01741 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01741 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01741 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01741 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01741 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01741 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01741 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01741 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
P01741 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
P01741 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
P01741 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
P01741 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P01741 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P01741 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01741 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01741 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01741 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01741 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01741 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01741 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01741 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01741 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01741 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01741 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01741 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01741 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01741 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01741 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01741 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01741 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01741 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01741 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01741 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01741 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01741 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01741 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01741 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01741 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01741 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01741 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01741 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01741 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01741 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01741 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01741 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01741 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01741 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01741 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01741 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01741 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01741 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01741 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01741 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01741 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01741 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01741 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01741 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01741 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01741 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01741 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01741 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01741 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01741 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01741 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01741 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01741 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01741 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01741 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01741 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01741 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01741 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01741 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01741 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01741 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01741 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01741 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01741 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01741 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01741 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01741 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01741 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01741 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01741 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01741 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01741 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01741 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01741 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01741 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01741 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01741 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01741 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01741 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01741 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01741 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01741 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01741 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01741 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms