Protein–RNA interactions for Protein: P01635

Ig kappa chain V-V region K2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01635 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01635 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P01635 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
P01635 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P01635 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P01635 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
P01635 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01635 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01635 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
P01635 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01635 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01635 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01635 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01635 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P01635 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P01635 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P01635 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P01635 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P01635 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P01635 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P01635 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P01635 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
P01635 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
P01635 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
P01635 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
P01635 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P01635 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P01635 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P01635 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
P01635 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
P01635 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
P01635 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
P01635 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P01635 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
P01635 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P01635 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P01635 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
P01635 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P01635 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P01635 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P01635 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
P01635 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
P01635 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
P01635 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
P01635 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
P01635 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01635 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01635 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01635 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01635 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01635 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01635 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01635 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01635 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01635 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01635 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01635 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01635 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01635 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01635 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01635 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01635 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01635 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01635 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01635 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01635 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01635 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01635 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
P01635 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01635 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01635 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01635 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01635 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01635 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01635 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01635 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01635 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01635 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01635 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01635 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
P01635 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01635 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01635 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01635 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01635 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01635 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
P01635 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01635 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01635 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01635 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01635 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01635 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01635 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01635 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01635 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01635 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01635 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01635 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01635 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01635 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms