Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mtatp6P00848 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mtatp6P00848 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mtatp6P00848 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mtatp6P00848 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mtatp6P00848 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mtatp6P00848 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mtatp6P00848 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mtatp6P00848 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mtatp6P00848 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mtatp6P00848 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mtatp6P00848 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Mtatp6P00848 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mtatp6P00848 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mtatp6P00848 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mtatp6P00848 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mtatp6P00848 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Mtatp6P00848 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mtatp6P00848 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mtatp6P00848 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Mtatp6P00848 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mtatp6P00848 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mtatp6P00848 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mtatp6P00848 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mtatp6P00848 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mtatp6P00848 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mtatp6P00848 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mtatp6P00848 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mtatp6P00848 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mtatp6P00848 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mtatp6P00848 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mtatp6P00848 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mtatp6P00848 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mtatp6P00848 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Mtatp6P00848 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mtatp6P00848 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mtatp6P00848 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mtatp6P00848 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mtatp6P00848 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mtatp6P00848 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mtatp6P00848 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mtatp6P00848 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mtatp6P00848 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mtatp6P00848 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mtatp6P00848 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mtatp6P00848 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mtatp6P00848 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mtatp6P00848 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mtatp6P00848 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mtatp6P00848 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mtatp6P00848 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mtatp6P00848 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mtatp6P00848 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mtatp6P00848 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mtatp6P00848 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mtatp6P00848 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mtatp6P00848 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mtatp6P00848 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mtatp6P00848 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mtatp6P00848 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mtatp6P00848 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mtatp6P00848 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mtatp6P00848 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mtatp6P00848 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mtatp6P00848 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mtatp6P00848 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mtatp6P00848 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mtatp6P00848 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mtatp6P00848 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mtatp6P00848 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mtatp6P00848 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mtatp6P00848 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mtatp6P00848 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mtatp6P00848 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Mtatp6P00848 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mtatp6P00848 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mtatp6P00848 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mtatp6P00848 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mtatp6P00848 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mtatp6P00848 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mtatp6P00848 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mtatp6P00848 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mtatp6P00848 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mtatp6P00848 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mtatp6P00848 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mtatp6P00848 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Mtatp6P00848 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mtatp6P00848 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mtatp6P00848 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mtatp6P00848 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mtatp6P00848 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mtatp6P00848 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mtatp6P00848 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mtatp6P00848 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mtatp6P00848 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mtatp6P00848 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mtatp6P00848 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mtatp6P00848 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mtatp6P00848 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mtatp6P00848 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.7 ms