Protein–RNA interactions for Protein: O88958

Gnpda1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda1O88958 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gnpda1O88958 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gnpda1O88958 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gnpda1O88958 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gnpda1O88958 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gnpda1O88958 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gnpda1O88958 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gnpda1O88958 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gnpda1O88958 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gnpda1O88958 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gnpda1O88958 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gnpda1O88958 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gnpda1O88958 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gnpda1O88958 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gnpda1O88958 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gnpda1O88958 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gnpda1O88958 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gnpda1O88958 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gnpda1O88958 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gnpda1O88958 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gnpda1O88958 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gnpda1O88958 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gnpda1O88958 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gnpda1O88958 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gnpda1O88958 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gnpda1O88958 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gnpda1O88958 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gnpda1O88958 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gnpda1O88958 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gnpda1O88958 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gnpda1O88958 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gnpda1O88958 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gnpda1O88958 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gnpda1O88958 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gnpda1O88958 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gnpda1O88958 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gnpda1O88958 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gnpda1O88958 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gnpda1O88958 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gnpda1O88958 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gnpda1O88958 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gnpda1O88958 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gnpda1O88958 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gnpda1O88958 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gnpda1O88958 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gnpda1O88958 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gnpda1O88958 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gnpda1O88958 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gnpda1O88958 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gnpda1O88958 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gnpda1O88958 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gnpda1O88958 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gnpda1O88958 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gnpda1O88958 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gnpda1O88958 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gnpda1O88958 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gnpda1O88958 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gnpda1O88958 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gnpda1O88958 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gnpda1O88958 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gnpda1O88958 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gnpda1O88958 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gnpda1O88958 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gnpda1O88958 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gnpda1O88958 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gnpda1O88958 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gnpda1O88958 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gnpda1O88958 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gnpda1O88958 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gnpda1O88958 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gnpda1O88958 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gnpda1O88958 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gnpda1O88958 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gnpda1O88958 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gnpda1O88958 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gnpda1O88958 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gnpda1O88958 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gnpda1O88958 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gnpda1O88958 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gnpda1O88958 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gnpda1O88958 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gnpda1O88958 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gnpda1O88958 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gnpda1O88958 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gnpda1O88958 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gnpda1O88958 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gnpda1O88958 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gnpda1O88958 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gnpda1O88958 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gnpda1O88958 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gnpda1O88958 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gnpda1O88958 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gnpda1O88958 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gnpda1O88958 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gnpda1O88958 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gnpda1O88958 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gnpda1O88958 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gnpda1O88958 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gnpda1O88958 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gnpda1O88958 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms