Protein–RNA interactions for Protein: O88907

Pias1, E3 SUMO-protein ligase PIAS1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pias1O88907 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pias1O88907 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pias1O88907 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pias1O88907 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pias1O88907 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pias1O88907 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pias1O88907 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pias1O88907 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pias1O88907 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pias1O88907 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pias1O88907 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pias1O88907 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pias1O88907 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pias1O88907 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pias1O88907 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pias1O88907 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pias1O88907 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pias1O88907 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pias1O88907 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pias1O88907 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pias1O88907 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pias1O88907 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pias1O88907 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pias1O88907 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pias1O88907 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pias1O88907 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pias1O88907 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pias1O88907 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pias1O88907 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pias1O88907 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pias1O88907 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pias1O88907 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pias1O88907 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Pias1O88907 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pias1O88907 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pias1O88907 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pias1O88907 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pias1O88907 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pias1O88907 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pias1O88907 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pias1O88907 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pias1O88907 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pias1O88907 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pias1O88907 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pias1O88907 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pias1O88907 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pias1O88907 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pias1O88907 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pias1O88907 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pias1O88907 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Pias1O88907 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pias1O88907 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pias1O88907 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pias1O88907 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pias1O88907 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pias1O88907 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Pias1O88907 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pias1O88907 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pias1O88907 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pias1O88907 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pias1O88907 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pias1O88907 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pias1O88907 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pias1O88907 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pias1O88907 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pias1O88907 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pias1O88907 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pias1O88907 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pias1O88907 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pias1O88907 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pias1O88907 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pias1O88907 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pias1O88907 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pias1O88907 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pias1O88907 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pias1O88907 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pias1O88907 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pias1O88907 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pias1O88907 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pias1O88907 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pias1O88907 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pias1O88907 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pias1O88907 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pias1O88907 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pias1O88907 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pias1O88907 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pias1O88907 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pias1O88907 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pias1O88907 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pias1O88907 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pias1O88907 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pias1O88907 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pias1O88907 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pias1O88907 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pias1O88907 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pias1O88907 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pias1O88907 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pias1O88907 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pias1O88907 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pias1O88907 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms