Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CcnkO88874 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CcnkO88874 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CcnkO88874 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CcnkO88874 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CcnkO88874 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CcnkO88874 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CcnkO88874 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CcnkO88874 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CcnkO88874 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CcnkO88874 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CcnkO88874 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CcnkO88874 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CcnkO88874 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CcnkO88874 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CcnkO88874 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CcnkO88874 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CcnkO88874 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CcnkO88874 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CcnkO88874 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CcnkO88874 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CcnkO88874 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CcnkO88874 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CcnkO88874 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CcnkO88874 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CcnkO88874 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CcnkO88874 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CcnkO88874 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CcnkO88874 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CcnkO88874 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CcnkO88874 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CcnkO88874 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CcnkO88874 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CcnkO88874 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CcnkO88874 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CcnkO88874 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CcnkO88874 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CcnkO88874 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CcnkO88874 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CcnkO88874 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CcnkO88874 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CcnkO88874 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CcnkO88874 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CcnkO88874 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CcnkO88874 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CcnkO88874 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CcnkO88874 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CcnkO88874 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CcnkO88874 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CcnkO88874 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CcnkO88874 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CcnkO88874 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CcnkO88874 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CcnkO88874 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CcnkO88874 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CcnkO88874 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CcnkO88874 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CcnkO88874 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CcnkO88874 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CcnkO88874 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CcnkO88874 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CcnkO88874 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CcnkO88874 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CcnkO88874 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CcnkO88874 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CcnkO88874 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CcnkO88874 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CcnkO88874 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CcnkO88874 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CcnkO88874 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CcnkO88874 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CcnkO88874 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CcnkO88874 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CcnkO88874 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CcnkO88874 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CcnkO88874 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CcnkO88874 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CcnkO88874 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CcnkO88874 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CcnkO88874 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CcnkO88874 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CcnkO88874 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CcnkO88874 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CcnkO88874 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CcnkO88874 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CcnkO88874 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CcnkO88874 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CcnkO88874 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CcnkO88874 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CcnkO88874 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CcnkO88874 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CcnkO88874 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CcnkO88874 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CcnkO88874 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CcnkO88874 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CcnkO88874 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CcnkO88874 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CcnkO88874 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CcnkO88874 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CcnkO88874 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms