Protein–RNA interactions for Protein: O88602

Cacng2, Voltage-dependent calcium channel gamma-2 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng2O88602 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cacng2O88602 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cacng2O88602 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cacng2O88602 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cacng2O88602 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cacng2O88602 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cacng2O88602 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Cacng2O88602 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cacng2O88602 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cacng2O88602 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cacng2O88602 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cacng2O88602 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cacng2O88602 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacng2O88602 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacng2O88602 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacng2O88602 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacng2O88602 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacng2O88602 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacng2O88602 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacng2O88602 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacng2O88602 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacng2O88602 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacng2O88602 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacng2O88602 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cacng2O88602 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cacng2O88602 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cacng2O88602 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cacng2O88602 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacng2O88602 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacng2O88602 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacng2O88602 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacng2O88602 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacng2O88602 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacng2O88602 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacng2O88602 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacng2O88602 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacng2O88602 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacng2O88602 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacng2O88602 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cacng2O88602 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cacng2O88602 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cacng2O88602 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cacng2O88602 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cacng2O88602 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cacng2O88602 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cacng2O88602 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cacng2O88602 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cacng2O88602 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cacng2O88602 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cacng2O88602 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cacng2O88602 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cacng2O88602 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cacng2O88602 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cacng2O88602 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cacng2O88602 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cacng2O88602 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cacng2O88602 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cacng2O88602 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cacng2O88602 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cacng2O88602 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cacng2O88602 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cacng2O88602 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cacng2O88602 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cacng2O88602 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacng2O88602 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacng2O88602 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacng2O88602 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacng2O88602 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacng2O88602 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacng2O88602 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacng2O88602 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacng2O88602 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacng2O88602 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacng2O88602 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacng2O88602 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacng2O88602 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacng2O88602 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacng2O88602 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacng2O88602 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacng2O88602 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacng2O88602 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacng2O88602 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacng2O88602 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacng2O88602 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacng2O88602 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacng2O88602 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacng2O88602 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacng2O88602 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacng2O88602 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacng2O88602 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacng2O88602 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacng2O88602 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacng2O88602 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacng2O88602 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacng2O88602 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacng2O88602 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacng2O88602 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacng2O88602 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacng2O88602 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cacng2O88602 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms